要将小车拉摩托的情况变得合法，主要涉及到的是超限运输的许可问题。以下是我为您详细梳理的合法流程：
一、判断是否需要办理超限运输许可
首先，您需要判断小车拉摩托这一组合是否满足超限运输的条件。根据相关规定，如果车货总高度从地面算起超过4米、车货总宽度超过2.55米、车货总长度超过18.1米或车货总质量超过49吨，那么就需要办理超限运输许可。对于小车拉摩托的情况，虽然通常不会达到这么高的标准，但如果摩托的尺寸或重量使得整体组合超出了普通车辆的限制，就需要考虑办理许可。
二、准备申请材料
如果确定需要办理超限运输许可，您需要准备以下材料：
公路超限运输申请表：这是申请许可的基本表格，需要详细填写运输车辆、货物、路线等相关信息。
承运人的道路运输经营许可证：如果您是专业的运输公司或个体运输户，需要提供此证件以证明您具备从事运输业务的资质。
经办人的身份证件和授权委托书：如果经办人不是承运人本人，需要提供经办人的身份证件以及承运人出具的授权委托书。
车辆行驶证或者临时行驶车号牌：这是证明运输车辆合法上路的基本证件。
其他可能需要的材料：如果车货总高度、宽度、长度或质量超过了更高的标准（如车货总高度从地面算起超过4.5米等），或者运输过程中可能对公路造成严重影响，您还需要提交记录载货时车货总体外廓尺寸信息的轮廓图和护送方案。
三、选择申请途径并提交申请
根据运输路线的不同，您可以选择以下途径提交申请：
跨省大件运输：如果运输路线跨越多个省份，您需要向起运地省级交通运输主管部门提出申请，由其统一受理并组织协调沿线各省级交通运输主管部门联合审批。
省内大件运输：如果运输路线仅在一个省份内，您需要向该省的交通运输主管部门提出申请，由其受理并审批。具体是向市级还是县级交通运输主管部门申请，取决于运输路线的具体情况（如跨市、跨县或县内）。
您可以通过网站在线办理（如跨省大件运输并联许可系统、国家政务服务平台）、微信/支付宝小程序办理（如国家政务服务平台）或前往各地交通运输主管部门的窗口现场办理。
四、等待审批并遵守相关规定
提交申请后，您需要等待交通运输主管部门的审批。一旦获得许可，您需要严格按照指定的时间、路线和速度行驶公路，并悬挂明显标志以提醒其他车辆和行人注意。同时，您还需要确保运输过程中采取有效的防护措施，以保障公路的安全和畅通。
五、注意事项
未经许可，不得擅自行驶公路进行超限运输。
办理许可时，请确保提供的所有材料真实有效、齐全并符合法定形式。
如果运输过程中发生任何变化（如路线变更、货物增减等），请及时向交通运输主管部门报告并重新办理许可手续。
希望以上解答能够帮助您了解小车拉摩托如何合法运输的流程。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。