结论前置：

1. 总公司对分公司的债务原则上承担最终责任，分公司不具有独立法人资格，其民事责任由总公司承担。
2. 起诉分公司时是否应将总公司列为被告需视情况而定，一般情况下可以单独起诉分公司，但在分公司财产不足以清偿债务或存在特殊情形时，建议将总公司列为共同被告。

一、总公司对分公司债务的责任承担

根据《中华人民共和国公司法》第十四条：“公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。”
法律逻辑：分公司是总公司的分支机构，不具有独立的法人资格，其财产和责任均归属于总公司。因此，当分公司产生债务时，债权人原则上应直接向总公司主张权利，总公司需以自身全部财产对分公司的债务承担清偿责任。
例外情形：若分公司有独立的财产且足以清偿债务，且案件不涉及总公司或其他分公司的利益，债权人可以单独起诉分公司。但需注意，即使单独起诉分公司，若分公司财产不足，法院仍可能追加总公司为被告或直接执行总公司的财产。

二、起诉分公司时是否应将总公司列为被告

1. 一般原则：可以单独起诉分公司
若分公司有独立的财产和经营能力，且债务金额明确、责任清晰，债权人可以仅以分公司为被告提起诉讼。此时，法院会先以分公司的财产清偿债务，不足部分再由总公司补充承担。

2. 特殊情形：建议将总公司列为共同被告
以下情况建议将总公司列为共同被告，以降低诉讼风险：

• 分公司财产不足：若分公司无独立财产或财产不足以清偿债务，直接起诉总公司可避免执行程序中的追加被告环节，提高效率。
  
• 总公司存在过错：如总公司对分公司的债务存在直接指示、控制或滥用法人独立地位（如通过分公司转移财产逃避债务），债权人可主张总公司承担连带责任。
  
• 合同约定或特殊安排：若合同明确约定由总公司承担责任，或总公司与分公司之间存在内部协议且债权人认可，可直接起诉总公司。
  

法律依据：

• 《公司法》第十四条（分公司责任由总公司承担）；
  
• 《民法典》第七十四条（法人分支机构以自己名义从事民事活动，产生的民事责任由法人承担；也可以先以该分支机构管理的财产承担，不足以承担的，由法人承担）。

三、实践中的操作建议

1. 调查分公司财产状况：
   起诉前，通过查询工商登记信息、财务报表、银行流水等方式，评估分公司的偿债能力。若分公司财产充足，可单独起诉；若财产不足，需将总公司列为被告。

2. 准备充分证据：
   无论起诉分公司还是总公司，均需提供合同、交易记录、沟通记录等证据，证明债务关系及分公司与总公司的关联性（如总公司对分公司的控制文件、资金往来记录等）。

3. 灵活选择诉讼策略：

   • 若希望快速执行，可同时起诉分公司和总公司，要求法院判决二者承担连带责任；
     
   • 若仅起诉分公司，需在执行阶段申请追加总公司为被执行人（但可能增加诉讼周期）。
     

四、示例说明

案例1：A公司设立B分公司，B分公司与C签订合同，欠C货款100万元。B分公司有独立账户，账户余额50万元。

• 诉讼选择：C可单独起诉B分公司，法院判决B分公司以50万元清偿，不足部分由A公司补充承担；或直接起诉A公司和B分公司，要求二者连带清偿100万元。
  

案例2：A公司通过B分公司转移资产逃避债务，导致B分公司无财产清偿对C的债务。

• 诉讼选择：C可起诉B分公司，并主张A公司滥用法人独立地位，要求A公司对债务承担连带责任。
  

五、总结与建议

1. 总公司对分公司债务承担最终责任，但分公司财产可能被优先用于清偿债务。
   
2. 起诉时是否列总公司为被告需结合分公司财产、总公司过错及合同约定综合判断。为降低风险，建议将总公司列为共同被告，尤其在分公司财产不足或存在特殊情形时。
   
3. 具体操作需根据案情调整，如有疑问可直接向我咨询，我会结合证据和法律规定提供针对性建议。