中标后查出项目经理有在建项目，这一行为确实可能违反招标文件规定及法律法规，并可能导致一系列严重后果。以下从多个角度对此问题进行详细分析：
一、法律法规及招标规则层面
违反招标文件规定：
- 许多招标项目的招标文件中会明确规定，拟派项目经理在投标时不得有在建项目。这一要求旨在确保项目经理能够全身心投入到新项目中，保障项目的顺利进行。若违反此规定，投标人可能面临中标无效、罚款、限制参与招投标活动等行政处罚。
相关法律法规依据：
- 根据《中华人民共和国招标投标法》及相关实施条例，投标人应确保所提交信息的真实性、准确性和完整性。若项目经理在投标时隐瞒有在建项目的事实，可能构成虚假投标，从而受到法律的制裁。
二、招标人的处理措施
调查核实与沟通：
- 招标人在发现项目经理有在建项目后，应首先进行详细调查，核实该在建项目的真实性及其对本项目的影响。同时，与中标人进行沟通，要求其就项目经理在建项目情况作出书面解释，并提供合理说明。
后续行动决策：
- 若在建项目对本项目实施构成重大不利影响，招标人可依据招标文件及法律法规取消中标资格，没收投标保证金，并依次确定下一名中标候选人或重新组织招标。
- 若中标人能证明在建项目无实质性影响，且获得招标人的认可，招标人可能允许其继续履行合同，但通常会要求中标人采取保障措施，如增加项目管理团队关键人员，以确保项目顺利进行。
三、对项目实施的影响及风险
进度与质量风险：
- 项目经理同时负责多个项目可能导致精力分散，增加项目进度拖延和质量事故的风险。这不仅可能损害招标人的利益，还可能影响中标人的声誉和未来业务发展。
法律责任：
- 若因项目经理在建项目导致无法按时履行合同或造成质量问题，中标人可能需承担违约责任及相应法律后果。这包括赔偿招标人因此遭受的损失、支付违约金等。
四、应对策略与建议
立即核实与评估：
- 中标后应立即核实项目经理是否存在在建项目，并评估其对本项目的影响。这有助于及时发现潜在问题并采取措施加以解决。
积极沟通与协商：
- 与招标方保持密切沟通，共同探讨解决方案。如更换项目经理、调整项目计划等，以减轻或消除在建项目对本项目的影响。
审查合同条款与法律咨询：
- 仔细审查合同条款，明确双方权利义务。在必要时咨询专业法律顾问或律师，获取具体、专业的建议和指导。这有助于中标人更好地了解自身法律地位和责任，从而制定更合理的应对策略。
制定应急预案：
- 提前评估可能面临的法律风险，制定相应的应急预案和应对策略。这有助于中标人在面临突发情况时迅速作出反应，减轻损失并保障项目顺利进行。
综上所述，中标后发现项目经理有在建项目是一个复杂且敏感的问题。中标人应严格遵守法律法规和招标文件规定，积极与招标方沟通协商，制定合理解决方案以维护自身合法权益和项目的顺利实施。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。