司机开公司的车发生追尾事故，处理方式需结合事故责任、车辆保险及公司规定等多方面因素，具体如下：

1. 立即停车并保护现场
   根据《道路交通安全法》第七十条，发生交通事故后应立即停车，开启危险报警闪光灯，并在车后设置警示标志。若有人员伤亡，需第一时间拨打120急救电话，同时拨打122报警，等待交警到场处理。切勿擅自移动车辆或离开现场，否则可能构成交通肇事逃逸，承担刑事责任。

2. 确认事故责任
   交警到场后会通过勘查现场、调取监控、询问证人等方式出具《交通事故责任认定书》，明确双方责任比例。若司机负全责或主责，需承担对方车辆维修、人员医疗等损失；若对方也有责任，则按比例分担赔偿。责任认定是后续赔偿的关键依据，务必保留好认定书原件。

3. 联系保险公司报案
   公司车辆通常投保了交强险和商业险（如第三者责任险、车损险等）。司机需立即向保险公司报案（一般需在48小时内），提供事故时间、地点、责任认定书等信息。保险公司会派定损员评估损失，确定赔偿金额。若未及时报案，保险公司可能拒赔。

4. 区分公司责任与个人责任

   • 若司机属职务行为（如执行公司任务时发生事故）：根据《民法典》第一千一百九十一条，用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任。此时赔偿主体是公司，司机一般无需个人赔偿（但若存在故意或重大过失，公司可向司机追偿）。
     
   • 若司机非职务行为（如私自用车）：赔偿责任由司机个人承担，公司车辆保险可能不覆盖非职务行为导致的损失，需司机自行赔偿或通过个人保险理赔。

5. 处理车辆维修与赔偿

   • 对方车辆损失：由司机或公司（根据责任主体）联系对方保险公司定损，或通过己方保险公司“代位求偿”处理。
     
   • 己方车辆损失：若公司投保了车损险，由保险公司赔偿维修费用；若未投保，则由公司或司机（根据责任划分）承担。
     
   • 人员伤亡赔偿：包括医疗费、误工费、护理费等，优先由交强险赔偿，不足部分由商业险或责任方补充。

6. 内部处理与记录
   司机需向公司报告事故详情，配合公司调查。公司可能根据内部规定对司机进行处罚（如扣绩效、培训等），但处罚需合理且符合劳动合同约定。司机应保留事故相关证据（如照片、视频、医疗记录等），以备后续争议。

温馨提示：若事故涉及复杂情况（如对方索赔过高、保险拒赔、公司推诿责任等），建议司机及时收集证据并咨询专业律师，维护自身合法权益。如有具体问题，可直接向我提问，我会结合细节进一步分析。