电动自行车警告一般不会留下案底。以下是对这一问题的详细分析：

1. 警告的性质：

   • 电动自行车警告通常属于行政处罚中的一种轻微形式，它是对违反交通规则行为的一种警示和纠正，并不构成刑事犯罪。根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，对于非机动车（包括电动自行车）的轻微违法行为，交通管理部门可以给予警告或者罚款等行政处罚。

2. 案底的定义：

   • 案底，通常指的是个人因犯罪行为而被记录在刑事档案中的信息。它是对个人犯罪历史的正式记录，对个人的生活、工作、学习等方面可能产生重大影响。

3. 警告与案底的关系：

   • 由于警告是行政处罚的一种，它并不涉及刑事犯罪，因此不会在个人的刑事档案中留下案底。警告的记录可能会保存在交通管理部门的系统中，但这主要是用于对违法者进行教育和惩戒，并不构成对个人犯罪历史的记录。

4. 特殊情况：

   • 当然，也存在一些特殊情况。如果电动自行车的驾驶行为构成了刑事犯罪，如醉酒驾驶、交通肇事等，并且被依法追究了刑事责任，那么就会在个人的刑事档案中留下案底。但这种情况下的“案底”并非由警告产生，而是由刑事犯罪行为本身导致的。

5. 建议与注意事项：

   • 尽管电动自行车警告不会留下案底，但驾驶者仍应严格遵守交通规则，避免违法行为的发生。因为频繁的交通违法行为不仅可能面临更严厉的行政处罚，还可能对个人的信用评估、某些职业资格申请等产生一定影响。
   • 如果对交通管理部门的处罚有异议，可以依法提请行政复议或行政诉讼，以维护自己的合法权益。

综上所述，电动自行车警告一般不会留下案底，但驾驶者仍应遵守交通规则，确保自身和他人的安全。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。