结论前置：
一、农村增减挂项目的合法性
农村增减挂，即城乡建设用地增减挂钩，是指依据土地利用总体规划，将若干拟整理复垦为耕地的农村建设用地地块（即拆旧地块）和拟用于城镇建设的地块（即建新地块）等面积共同组成建新拆旧项目区，通过建新拆旧和土地整理复垦等措施，在保证项目区内各类土地面积平衡的基础上，最终实现增加耕地有效面积，提高耕地质量，节约集约利用建设用地，城乡用地布局更合理的目标。这一政策本身是为了优化土地资源配置，促进城乡协调发展，是合法的。
二、增减挂项目中可能存在的违法行为
然而，在增减挂项目的实施过程中，如果存在以下行为，则可能构成违法：
未经合法程序征收土地：如果项目实施过程中，未按照法定程序进行土地征收，如未征求村民意见、未获得村民同意或在村民不知情的情况下强行推进项目，这违反了《中华人民共和国村民委员会组织法》关于村民自治和民主决策的规定。
补偿不合理：如果土地征收补偿标准低，未按照土地实际价值和市场价格给予合理补偿，或者补偿不及时、不到位，影响村民生活，这违反了《中华人民共和国土地管理法》中关于公平、合理补偿的规定。
侵犯村民其他合法权益：如安置方式不合理，提供的安置住房不符合村民需求或预期，或者未考虑村民失地后的就业困难，缺乏有效就业培训和安置措施等，都可能构成对村民合法权益的侵犯。
三、院子是否违法的问题
关于院子是否违法的问题，这主要取决于院子是否符合土地利用规划和宅基地使用规定。如果院子是在合法宅基地上建造的，且符合当地土地利用规划和宅基地使用标准，那么院子本身是合法的。然而，在增减挂项目中，如果院子所在的土地被纳入项目区，且需要被征收或整理复垦，那么就需要按照法定程序进行，确保村民的合法权益不受损害。如果未经合法程序处理院子所在的土地，或者处理过程中存在违法行为，那么这些具体行为就是违法的。
四、法律建议
加强法律法规宣传和教育：相关部门应加大对增减挂政策及相关法律法规的宣传力度，提高村民的法律意识和维权能力。
完善程序，确保村民参与和监督：在项目实施过程中，应严格按照法定程序进行，充分征求村民意见，确保村民的知情权、参与权和监督权得到有效保障。
建立健全纠纷解决机制：当村民合法权益受到侵害时，应建立畅通的维权渠道和有效的纠纷解决机制。村民可通过协商、调解、行政复议、行政诉讼等方式维护自身权益。
及时咨询与维权：如果您在增减挂项目中遇到任何违法行为或合法权益受到侵害的情况，请及时向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。
综上所述，农村增减挂项目本身并不违法，但如果在实施过程中存在违法行为或侵犯村民合法权益的情况，则这些具体行为是违法的。院子是否违法需看其是否符合土地利用规划和宅基地使用规定以及是否在增减挂项目中被合法处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。