在刑事诉讼中，当简易程序因特定原因不再适用而转为普通程序时，审理期限的计算是一个关键问题。以下是对这一问题的详细解析：

一、审理期限的重新计算

当刑事案件由简易程序转为普通程序后，审理期限应从转换程序后的人民法院决定立案（或称为“决定转为普通程序”）之日起重新计算。这意味着，之前在简易程序下已经进行的审理时间，不会计入普通程序的审理期限。这一规定确保了案件在转为普通程序后，能够有充足的时间进行全面、公正的审理。

二、普通程序审理期限的一般规定

在普通程序下，人民法院审理公诉案件的审理期限有明确规定：

• 一般情况：应当在受理后二个月以内宣判，至迟不得超过三个月。
• 特殊延长：对于可能判处死刑的案件、附带民事诉讼的案件，或者具有特定复杂情形的案件（如交通十分不便的边远地区的重大复杂案件等），经上一级人民法院批准，可以延长三个月；因特殊情况还需要延长的，需报请最高人民法院批准。

三、简易程序转普通程序的特定情形

简易程序转为普通程序通常发生在以下情形：

1. 被告人异议：若被告人在简易程序进行过程中对适用简易程序提出异议，基于程序正当性原则，案件应立即转为普通程序审理。
2. 不符合简易程序条件：当案件出现不适用简易程序的情形时（如被告人是盲、聋、哑人，或者有重大社会影响，或者共同犯罪案件中部分被告人不认罪等），应转为普通程序。
3. 案情复杂：在简易程序审理过程中，若发现案情复杂，超出了简易程序的审理能力范围，法院应依职权主动将案件转为普通程序。

四、其他相关期限与程序调整

• 送达期限：转为普通程序后，人民法院需按照普通程序的要求重新确定送达起诉书副本等诉讼文书的期限。通常，起诉书副本应至迟在开庭十日以前送达被告人及其辩护人。
• 补充侦查期限：若在简易程序转为普通程序过程中，人民检察院认为需要补充侦查的，其期限为一个月，且以二次为限。补充侦查完毕移送人民法院后，人民法院应重新计算审理期限。

五、实际应用中的注意事项

在实际操作中，律师和当事人应密切关注案件是否满足简易程序转为普通程序的条件，并及时向法院提出意见。同时，在案件转为普通程序后，应了解新的审理期限和相关程序要求，确保当事人的合法权益得到充分保障。对于可能出现的审理期限延长情况，也应提前做好准备，以便有效应对。

综上所述，刑事案件由简易程序转为普通程序后，审理期限及相关程序均需按照法律规定进行重新调整和计算。这一规定确保了案件的公正、全面审理，也体现了法律对当事人权益的充分保障。