结论：公司在进行背景调查时，能否查到员工在厂里自离的情况，主要取决于背景调查的具体内容、调查方式以及原厂的相关记录情况。
分析：
背景调查的内容与范围：
- 背景调查通常包括对员工的教育背景、工作经历、职业资格、信用记录等方面的核实。如果调查内容中明确包含了员工的工作经历及离职情况，且调查方式得当，那么理论上是有可能查到员工在厂里自离的情况的。
调查方式：
- 背景调查可以通过多种方式进行，如直接联系原雇主、查询公开记录、使用第三方背景调查服务等。如果调查机构或公司直接联系了员工原工作的厂，且该厂有详细的员工离职记录，那么自离的情况就很有可能被查到。
- 另外，如果员工在自离时未按照正规程序办理离职手续，如未提交离职申请、未进行工作交接等，这些行为也可能在原厂的记录中留下痕迹，从而被背景调查所发现。
原厂的相关记录情况：
- 并非所有厂都会详细记录员工的离职情况，特别是对于一些小型或管理不规范的厂来说，可能并没有完善的员工离职记录系统。在这种情况下，即使公司进行背景调查，也可能难以查到员工自离的具体情况。
- 另一方面，如果原厂有完善的员工管理系统和离职记录，且这些记录被妥善保存，那么公司在进行背景调查时就有可能获取到这些信息。
法律建议：
- 对于员工而言，无论因何种原因离职，都应尽量按照正规程序办理离职手续，以避免留下不良记录。同时，在求职时也应如实告知自己的工作经历和离职情况，以免因隐瞒或虚假陈述而引发法律纠纷。
- 对于公司而言，在进行背景调查时应遵守相关法律法规和道德规范，确保调查内容的合法性和正当性。同时，也应尊重员工的隐私权和个人信息保护权，避免过度调查或泄露员工个人信息。
可能后果：
- 如果员工在自离时存在违规行为或未按照正规程序办理离职手续，且这些行为被背景调查所发现，那么可能会对员工的求职产生不利影响。公司可能会因此认为员工缺乏职业操守或责任心，从而拒绝录用或解除已建立的劳动关系。
- 另一方面，如果公司在进行背景调查时违反了相关法律法规或道德规范，如侵犯员工隐私权或泄露员工个人信息等，那么公司可能会面临法律责任和声誉损失。
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