在民事诉讼中，不应当结案的情形主要包括以下几种：
案件事实尚未查清：
- 如果案件的关键事实尚未查清，或者证据不足，导致法院无法对案件作出准确判断，那么案件就不应当结案。因为结案意味着法院已经对案件作出了最终裁决，如果事实不清，裁决可能不公正，损害当事人的合法权益。例如，在一起合同纠纷中，如果双方对合同的具体条款存在争议，且没有足够的证据来证明各自的主张，那么法院就不能轻易结案，而需要进一步调查取证，查清事实后再作裁决。
法律适用存在争议：
- 在某些案件中，法律适用可能存在争议，即不同的法律条款或司法解释可能适用于同一案件，导致法院在裁决时面临困难。在这种情况下，案件也不应当轻易结案。法院需要仔细研究相关法律条款和司法解释，结合案件的具体情况，选择最合适的法律适用。如果法律适用问题复杂且难以解决，法院可能会将案件提交给上级法院或相关法律机构进行咨询或裁决。
当事人提出新的证据或申请：
- 在诉讼过程中，如果当事人提出了新的证据或申请，且这些证据或申请可能对案件的裁决产生重大影响，那么案件就不应当结案。法院需要重新审查这些新证据或申请，并根据审查结果决定是否需要重新开庭审理或作出新的裁决。例如，在一起侵权纠纷中，如果被告在诉讼过程中提出了新的证据来证明自己没有侵权行为，那么法院就需要重新审查这些证据，并根据审查结果来决定是否维持原判或作出新的裁决。
案件涉及重大社会利益或公共利益：
- 如果案件涉及重大社会利益或公共利益，如环境保护、消费者权益保护等，那么法院在裁决时需要更加谨慎。在这种情况下，即使案件事实已经查清，法律适用也没有争议，但法院仍然可能考虑不结案，而是将案件提交给相关政府部门或社会机构进行调解或处理。因为这类案件的处理结果往往会对社会产生广泛影响，法院需要确保裁决的公正性和合理性。
诉讼程序存在瑕疵或违法：
- 如果诉讼程序存在瑕疵或违法情况，如未经合法传唤、未给予当事人充分的陈述和辩论机会等，那么案件也不应当结案。因为诉讼程序的公正性是保障当事人合法权益的重要基础，如果程序存在瑕疵或违法，那么裁决结果可能不公正，损害当事人的合法权益。在这种情况下，法院需要纠正程序瑕疵或违法情况，并重新进行诉讼程序。
在遇到上述情形时，当事人可以采取以下措施：
- 如果认为案件事实尚未查清或法律适用存在争议，可以积极向法院提供证据或提出法律意见，以支持自己的主张。
- 如果提出了新的证据或申请，且这些证据或申请可能对案件的裁决产生重大影响，可以及时向法院提交并说明其重要性。
- 如果案件涉及重大社会利益或公共利益，可以积极向相关部门或社会机构反映情况，并寻求他们的支持和帮助。
- 如果发现诉讼程序存在瑕疵或违法情况，可以向法院提出异议或申请复议，以维护自己的合法权益。
总之，在民事诉讼中，不应当结案的情形多种多样。当事人需要密切关注案件的进展情况，并在必要时采取积极措施来维护自己的合法权益。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。