当建设工程施工合同被认定无效时，关于赔偿的问题，我们需要依据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释来进行详细分析。以下是对此问题的清晰、详细且有深度的解答：
一、合同无效的情形
首先，我们需要明确哪些情况下建设工程施工合同会被认定无效。根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》第一条，主要包括以下情形：
- 承包人未取得建筑业企业资质或者超越资质等级；
- 没有资质的实际施工人借用有资质的建筑施工企业名义；
- 建设工程必须进行招标而未招标或者中标无效。
二、合同无效后的处理原则
当建设工程施工合同无效时，如果建设工程经竣工验收合格，承包人仍然有权请求参照合同约定支付工程价款。这一原则体现了对实际完成工程量的认可和保护，确保承包人的合法权益得到保障。
三、具体赔偿规定
工程质量合格：
- 承包人有权请求参照合同约定支付工程价款。即使合同无效，只要工程质量合格，承包人仍可按照合同约定的价格获得相应的工程款。
工程质量不合格：
- 若修复后的建设工程经竣工验收合格，发包人可以请求承包人承担修复费用。此时，承包人虽无权直接请求支付全部工程款，但仍可要求支付除修复费用外的合理部分。
- 若修复后的建设工程经竣工验收仍不合格，承包人则无权请求支付工程价款。这强调了工程质量在合同履行中的核心地位。
损失赔偿：
- 合同无效后，有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失。若双方均有过错，则需各自承担相应的责任。这一规定旨在平衡双方利益，防止因合同无效导致的不公平后果。
- 赔偿条件包括过错存在、损失事实以及过错行为与损失之间的直接联系。责任分担则根据过错程度和性质，按比例分担。
垫资与利息：
- 当事人对垫资和垫资利息有约定且不违反法律规定的，承包人可以请求按照约定返还垫资及其利息。这保护了承包人在资金垫付方面的合法权益。
实际支出费用的补偿：
- 在特定情况下，如合同无效是由于发包人的过错导致的，承包人可以请求发包人赔偿其为订立合同或准备履行合同而支出的合理费用。这些费用包括但不限于为工程勘察、设计、施工等所做的前期准备工作所产生的费用。
四、实际操作建议
- 检查合同约定：首先，检查合同中是否有关于无效后处理的约定。若约定合法且有效，则按约定执行。
- 分析具体情况：在无约定或约定不合法时，需仔细分析合同内容、当事人行为及法律法规，以确定赔偿方式和数额。
- 寻求专业咨询：面对复杂情况，建议及时寻求专业律师咨询，以更好地维护自身权益。
综上所述，当建设工程施工合同无效时，赔偿问题需综合考虑多个方面，包括工程质量、损失赔偿、垫资与利息以及实际支出费用的补偿等。在具体操作中，应遵循法律规定并结合实际情况进行细致分析。