结论前置：政府采购合同并非必须由代理机构盖章见证，是否需要盖章见证取决于采购方式及具体规定。以下是具体分析：

1. 法定要求层面
   根据《中华人民共和国政府采购法》第四十四条，政府采购合同应当采用书面形式，但法律并未强制要求代理机构盖章见证。合同的法律效力主要取决于双方签字盖章（采购人与供应商）及合同内容的合法性，代理机构的见证并非法定要件。

2. 采购方式差异

   • 公开招标/邀请招标：若通过代理机构组织招标，合同签订通常需代理机构参与，但盖章见证并非强制。实践中，代理机构可能以“见证方”身份盖章，但此行为更多是内部管理或风险防控措施，而非法律要求。
     
   • 竞争性谈判/单一来源采购：此类方式对代理机构参与程度要求较低，合同签订一般无需代理机构盖章见证。
     
   • 自行采购：若采购人未委托代理机构，合同签订完全由采购人与供应商完成，无需第三方见证。

3. 地方或行业规定补充
   部分地区或行业可能出台补充规定，要求代理机构在合同中盖章见证（如为加强监管或留存备案）。此时需以具体规定为准，但此类要求属于地方性或行业性规范，非全国统一强制标准。

4. 实践建议

   • 核查采购文件：若采购文件中明确要求代理机构盖章见证，则需遵守；若未提及，则无需强制。
     
   • 风险防控：即使无强制要求，代理机构盖章见证可降低合同纠纷风险（如证明程序合规性），采购人可根据实际需求决定是否采用。
     

总结：政府采购合同的法律效力不依赖于代理机构盖章见证，但具体操作中需结合采购方式、地方规定及风险防控需求综合判断。如有进一步疑问，可直接向我咨询。