监理费约定由乙方承担是可以的，但具体是否合法有效需结合合同内容、行业惯例及法律规定综合判断。以下从不同角度进行分析：

1. 合同自由原则
   根据《中华人民共和国民法典》第四百七十条，合同双方有权在平等自愿基础上约定合同条款，包括费用承担方式。若监理费由乙方承担的约定系双方真实意思表示，且不违反法律、行政法规的强制性规定（如《招标投标法》中关于必须招标项目监理费的规定），则该约定合法有效。

2. 行业惯例与公平性

   • 行业惯例：在建设工程领域，监理费通常由建设单位（甲方）承担，因监理服务本质是为甲方监督工程质量、进度等。但若乙方（如施工方）因自身原因需额外引入监理（如为证明自身合规性），或合同明确约定乙方承担监理费作为对价（如甲方降低工程款），则可能被认可。
     
   • 公平性：若监理费约定由乙方承担导致合同权利义务明显失衡（如乙方已承担高额风险，再负担监理费显失公平），可能触发《民法典》第一百五十一条关于显失公平的规定，乙方可请求撤销或变更合同。

3. 特定情形下的合法性

   • 政府投资项目：根据《政府投资条例》，监理费通常纳入项目总投资，由财政资金支付，若约定由乙方承担可能涉嫌违规。
     
   • EPC总承包模式：若乙方为总承包方，其合同范围可能包含监理职责，此时监理费由乙方承担符合合同逻辑。
     
   • 第三方委托监理：若甲方单独委托第三方监理，费用一般由甲方承担；但若乙方同意在合同中明确承担该费用，则属有效约定。

4. 法律后果与建议

   • 合法有效情形：若约定符合合同自由原则且无其他违法情形，乙方需按约支付监理费，否则可能构成违约。
     
   • 争议解决：若双方对监理费承担产生争议，可依据合同条款、交易习惯及《民法典》相关规定，通过协商、诉讼或仲裁解决。
     
   • 建议：在签订合同时，明确监理费的具体金额、支付方式及调整机制，避免模糊表述；同时评估费用承担对合同整体公平性的影响，必要时可咨询律师进行风险审查。

总结：监理费由乙方承担的约定在法律上并非绝对禁止，但需结合合同目的、行业惯例及公平原则综合判断。若您面临具体合同纠纷或需进一步审查合同条款，可直接向我咨询，我将结合实际情况提供专业法律意见。