在刑事自诉案件中，如果被告人是单位且找不到该单位或其相关负责人，法院会依据相关法律法规和案件具体情况，采取一系列措施来确保诉讼程序的合法性和公正性。以下是对这一问题的详细解答：
一、法律依据
《中华人民共和国刑事诉讼法》
- 第二百一十一条：对于缺乏罪证的自诉案件，如果自诉人提不出补充证据，法院应说服其撤回自诉或裁定驳回。这一条款同样适用于被告人为单位且无法找到的情况，如果自诉人无法提供足够证据，法院可能会采取相应措施。
- 第二百零六条：因被告人下落不明等原因导致案件无法继续审理的，法院可以中止审理。这同样适用于单位被告人找不到的情况。
《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国刑事诉讼法〉的解释》
- 相关条款明确了在自诉案件中，如果被告人下落不明，法院在立案前可能说服自诉人撤回起诉，或裁定不予受理；在立案后，则可能采取公告送达、说服撤诉、裁定驳回或中止审理等措施。
二、处理方式
立案前
- 明确被告人信息：法院会要求自诉人提供被告单位的准确信息和可能去向，包括单位名称、地址、法定代表人或负责人姓名等。如果自诉人无法提供有效信息，法院可能以被告人下落不明为由，说服自诉人撤回起诉；自诉人不撤回起诉的，裁定不予受理。
立案后
- 要求补充证据或协助查找：法院会要求自诉人提供补充证据，并可能要求其协助查找被告单位的下落。自诉人有举证责任，需尽量提供相关线索，如单位可能的经营场所、银行账户信息等。
- 公告送达：如果案件符合立案条件且有必要继续审理，法院可采取公告送达方式。自发出公告之日起六十日，即视为送达。公告送达后，被告单位仍未到庭的，不影响案件审理。但需注意，公告送达并不意味着被告单位一定会被缺席审判，还需看案件具体情况和法律规定。
- 说服撤诉或裁定驳回：如果因被告单位找不到导致自诉人无法提供充分证据，且无法通过其他方式查明案件真相，法院会说服自诉人撤回自诉；若不撤回，则裁定驳回起诉。
- 中止审理：如果在审理过程中被告单位下落不明，导致案件无法继续审理，法院会依法中止审理。当中止审理的原因消失后（如被告单位重新出现或被找到），法院将恢复审理程序。
三、特定情况下的处理
- 缺席审判的适用：需要注意的是，缺席审判通常适用于特定类型的案件，如贪污贿赂犯罪、严重危害国家安全犯罪等，并且需要经过最高人民检察院的核准。在刑事自诉案件中，尤其是被告单位找不到的情况下，缺席审判并不常见。
四、注意事项
- 自诉人的责任：自诉人有责任积极与法院配合，提供相关证据和信息，以协助法院准确查明案件事实真相。如果自诉人无法提供足够证据或信息，可能会导致案件无法继续审理或被驳回。
- 法院的公正性：法院在整个处理过程中会确保诉讼程序的合法性和公正性，保护当事人的合法权益。无论被告单位是否找到，法院都会依法进行审理和判决。
综上所述，当刑事自诉案件中的被告单位找不到时，法院会根据具体法律法规和案件情况采取相应措施进行处理。自诉人应积极配合法院的工作，提供相关证据和信息，以推动案件的顺利进行。