核心结论：原车主发现车辆被套牌并产生高速过路费后，应立即采取以下措施保护自身权益，避免承担不应由自己承担的费用及法律责任。具体处理步骤如下：

1. 立即报警并固定证据

• 报警：原车主应第一时间向公安机关交通管理部门（如交警队）报案，说明车辆被套牌的情况。报警时需提供车辆行驶证、驾驶证、身份证等原件及复印件，并详细描述车辆被套牌的时间、地点及可能的使用情况。
• 固定证据：若原车主发现套牌车在高速上有通行记录，可向高速公路管理部门申请调取相关监控录像或通行记录，作为证据提交给警方。这些证据有助于证明原车主并未实际使用车辆产生该笔费用。

2. 联系高速公路管理部门

• 提出异议：原车主应主动联系产生过路费的高速公路管理部门，说明车辆被套牌的情况，并提交报警回执、车辆行驶记录等相关证据，要求对过路费进行核查并免除不应由自己承担的费用。
• 申请复核：若高速公路管理部门初步认定费用应由原车主承担，原车主可申请复核，并提供更充分的证据证明套牌事实。

3. 配合警方调查

• 提供线索：原车主应积极配合警方的调查工作，提供任何可能有助于找到套牌车的线索，如车辆外观特征、可能的行驶路线等。
• 跟进进展：定期向警方询问案件进展，确保套牌车被及时查获，避免类似情况再次发生。

4. 法律途径维权（如必要）

• 起诉套牌者：若套牌者被查获，原车主可依法向法院提起民事诉讼，要求套牌者赔偿因套牌行为产生的所有损失，包括过路费、车辆维修费、误工费等。
• 申请行政复议或诉讼：若高速公路管理部门或交警部门在处理过程中存在不当行为，原车主可依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自身合法权益。

5. 加强车辆管理，预防套牌

• 定期查询违章记录：原车主应定期通过交管部门官方网站或APP查询车辆违章记录，及时发现并处理异常情况。
• 安装防盗装置：考虑为车辆安装GPS定位装置或防盗报警器，提高车辆安全性，降低被套牌的风险。

温馨提示：车辆套牌行为不仅侵犯了原车主的合法权益，还可能涉及其他违法行为。原车主在处理此类问题时，应保持冷静，依法维权，避免采取过激行为。如有任何疑问或需要进一步帮助，请随时向我咨询。