您好，针对您提出的“在部队开车闯了红灯怎么处理”的问题，我会从交通法规和部队内部管理两个层面为您详细解答。

首先，从交通法规的角度来看，无论是在地方道路还是部队内部道路，闯红灯都是一种违反《道路交通安全法》的行为。根据该法规定，驾驶机动车不按交通信号灯指示通行的，将会受到相应的行政处罚，这通常包括罚款和记分。具体来说，可能会面临几百元的罚款，并且根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，一次闯红灯行为会被记6分。

其次，从部队内部管理的角度来看，部队对驾驶员的行为规范有着更为严格的要求。在部队内部，闯红灯不仅违反了交通法规，还可能违反了部队的行车纪律和规定。因此，除了接受地方交通管理部门的处罚外，驾驶员还可能面临部队内部的纪律处分。这种处分可能包括警告、记过、扣发奖金、停职检查等，具体取决于部队的规章制度和违规情节的严重程度。

此外，如果驾驶员是党员，还需要考虑党纪处分的问题。虽然闯红灯本身不构成犯罪，但根据《中国共产党纪律处分条例》的相关规定，党员有其他违法行为，损害党、国家和人民利益的，应当视具体情节给予警告直至开除党籍处分。不过，在实际操作中，对于闯红灯这样的轻微交通违法行为，如果驾驶员已经接受了地方交通管理部门的处罚，并且没有造成严重后果，一般不再追究党纪责任。

综上所述，在部队开车闯了红灯，驾驶员不仅需要接受地方交通管理部门的行政处罚，还可能面临部队内部的纪律处分。因此，我建议您在驾驶时务必严格遵守交通法规和部队的行车纪律，确保行车安全。如果已经发生了闯红灯的行为，应主动接受处罚，并从中吸取教训，避免类似情况再次发生。