结论：关于小型普通客车在农村道路限速40开60多，且碰到横穿马路的行人会被扣多少分的问题，这主要取决于事故的具体情况以及交警部门的认定，但超速行驶本身会面临相应的扣分和罚款处罚。同时，若事故中行人存在过错，如横穿马路未注意观察等，也会影响事故责任的划分。

详细分析：

1. 超速行驶的处罚：

   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，驾驶机动车行驶超过规定时速未达50%的，一般会面临警告或者二十元以上二百元以下罚款，并记3分。在本案例中，车辆在限速40的道路上行驶至60多，属于超速行驶，但未达到50%的超速比例（即未超过60km/h），因此会面临上述的处罚。

2. 事故责任的划分：

   • 事故责任的划分不仅取决于车速，还取决于行人的行为、道路条件、车辆状况等多种因素。如果行人横穿马路时未注意观察来往车辆，或者存在其他过错行为，那么行人也可能承担一定的责任。
   • 交警部门会根据现场勘查、证人证言、监控视频等证据，综合判断事故双方的责任比例。

3. 可能的法律后果：

   • 如果车辆超速行驶被认定为事故的主要原因，那么驾驶员除了面临超速的处罚外，还可能需要承担事故的主要或全部责任，包括赔偿行人的医疗费用、误工费等损失。
   • 如果行人存在过错，如横穿马路未注意观察等，那么行人的过错行为也会减轻驾驶员的责任。

建议：

• 在驾驶过程中，务必遵守交通规则，不要超速行驶，以确保自己和他人的安全。
• 如果发生交通事故，应立即停车保护现场，并报警等待交警处理。同时，积极与行人沟通，了解其伤情，并视情况提供必要的帮助。
• 在处理交通事故时，建议咨询专业律师的意见，以便更好地维护自己的合法权益。

额外提醒：

• 农村道路往往路况复杂，视线不佳，驾驶员在行驶过程中应更加谨慎，注意观察路况和行人动态。
• 行人横穿马路时也应遵守交通规则，注意观察来往车辆，确保安全后再通过。

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