在肇事逃逸双方达成调解的情况下，交警通常不需要在调解协议书上签字，但交警部门可能会对调解协议进行备案或确认。以下是具体分析：

1. 调解协议的性质：肇事逃逸后的调解协议本质上是双方当事人（即肇事方和受害方）就民事赔偿部分达成的合意，属于民事合同的范畴。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事合同在双方自愿、平等的基础上签订即具有法律效力，无需第三方（如交警）签字确认。

2. 交警的角色：交警在交通事故处理中的主要职责是调查事故责任、维护交通秩序、对违法行为进行处罚等。在双方自愿调解的情况下，交警可以居中协调，帮助双方沟通、协商，但调解协议的签订和履行主要依赖于双方当事人的自觉和诚信。交警的签字并非调解协议生效的必要条件。

3. 交警部门的备案或确认：虽然交警不需要在调解协议书上签字，但为了确保调解协议的合法性和有效性，以及便于后续的执行和监督，交警部门可能会要求双方将调解协议提交备案，或者对调解协议进行形式上的确认（如加盖公章或出具调解书）。这种备案或确认并不改变调解协议的民事合同性质，但可以增加其公信力和执行力。

4. 特殊情况：如果调解协议涉及刑事责任的免除或减轻（如肇事逃逸者通过赔偿获得受害方的谅解，从而可能减轻刑事处罚），这种情况下，调解协议可能需要经过公安机关或检察机关的审查确认。但这已经超出了单纯民事调解的范畴，涉及到刑事诉讼程序。

建议：

• 在签订调解协议前，建议双方当事人充分沟通、协商，确保协议内容明确、具体、可行。
• 如果可能的话，可以请律师或法律专业人士对调解协议进行审查，以确保其合法性和有效性。
• 调解协议签订后，建议双方当事人妥善保管协议原件，并按照协议约定履行各自的义务。
• 如果在履行过程中出现争议或纠纷，可以及时向交警部门或法院寻求帮助和解决。