厂里面扣违约金是否合法，需根据具体情况判断，以下分情况说明：

1. 合法扣取违约金的情形

   • 违反服务期约定：如果工厂为你提供了专项培训费用，并进行了专业技术培训，同时双方约定了服务期，而你违反了这一约定提前离职，那么工厂有权按照约定扣取违约金。但违约金的数额不得超过工厂提供的培训费用，且需按服务期尚未履行部分所应分摊的费用计算。例如，工厂为你支付了1万元的培训费用，约定服务期为2年，你工作了1年后离职，那么工厂最多只能扣取你5000元的违约金。
   • 违反竞业限制约定：如果你与工厂在劳动合同中约定了竞业限制条款，即你在离职后一定期限内不得从事与工厂有竞争关系的工作，而你违反了这一约定，那么工厂也有权按照约定扣取违约金。

2. 不合法扣取违约金的情形

   • 法律未规定的其他情形约定违约金：除了上述服务期和竞业限制两种情形外，工厂不得随意与你约定其他由你承担违约金的条款。例如，工厂规定你提前离职、请假等需支付违约金，这类约定是无效的，工厂据此扣取违约金也是不合法的。
   • 以违约金名义变相克扣工资：工厂不得以违约金的名义，在无合法依据的情况下随意扣除你的工资。如工厂以经营效益不好为由要求你承担“经营风险违约金”，这种行为同样违法。根据《中华人民共和国劳动法》，工资应以货币形式按月支付给你本人，不得克扣或无故拖欠。

员工权益保护建议：

• 如果你认为工厂扣取违约金的行为不合法，首先可与工厂进行协商解决，明确表达你的立场和理由。
• 如果协商不成，你有权向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。在投诉或申请仲裁时，你需要提供相关证据，如劳动合同、培训协议、工资条等，以证明工厂扣取违约金的行为不合法。

总结： 工厂扣取员工违约金是否合法，关键在于扣取行为是否有明确的法律依据和合同约定。仅在违反服务期约定和竞业限制约定的情形下，工厂才有权按约定扣取违约金。对于其他无合法依据的扣取行为，你应依法维权。因此，在处理此类问题时，你需仔细审查合同内容和相关法律规定，确保自己的权益不受侵害。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。