出资款未按约定时间缴纳的违约利息计算，需根据合同约定、法律规定及实际情况综合判断，具体如下：

1. 合同有明确约定时
   若股东协议或公司章程中明确规定了逾期出资的违约利息计算方式（如按日万分之五计算违约金，或约定固定利率），则优先适用合同约定。但需注意：

   • 违约金不得过分高于实际损失（通常不超过损失的30%），否则对方可请求法院或仲裁机构调整；
     
   • 若约定利息过高（如超过LPR的4倍），可能被认定为“高利贷”而部分无效。

2. 合同未约定或约定不明时
   根据《公司法》及相关司法解释，可参考以下方式：

   • 按实际损失赔偿：以逾期出资导致的公司损失（如融资成本、项目延误损失等）为基准，由违约方赔偿；
     
   • 参照民间借贷利率：若公司因逾期出资产生资金缺口，可主张按同期LPR（贷款市场报价利率）计算利息，但需证明损失与逾期出资的因果关系；
     
   • 法定违约金：部分地区法院可能支持按未出资额的日万分之二至五计算违约金，但需结合具体案情。

3. 特殊情形处理

   • 部分出资逾期：仅对未缴纳部分计算违约利息，已缴纳部分不受影响；
     
   • 多次逾期：可分段计算利息，或按累计逾期天数统一计算；
     
   • 抽逃出资：若股东出资后抽逃，需返还出资并赔偿利息，利息计算方式同上。

建议：

• 优先通过协商明确违约责任，避免诉讼成本；
  
• 签订合同时，建议明确约定逾期出资的违约金标准（如“按未出资额的日万分之三支付违约金”）；
  
• 若发生纠纷，及时收集证据（如催款通知、公司损失证明等）以维护权益。
  

如有具体合同条款或案件细节，可进一步向我咨询，我会结合实际情况为您详细分析。