针对您提出的“刑事案件挂案超三年怎么处理”的问题，这是一个涉及法律追诉时效和案件处理程序的复杂问题，我会结合相关法律规定和司法实践，为您详细解答。
首先，我们需要明确“挂案”的含义。挂案通常指的是案件在侦查机关立案后，由于各种原因（如证据不足、犯罪嫌疑人逃逸等）未依法进行侦查、审查起诉或审判，而长期搁置的情况。当这样的案件超过三年时，我们需要从追诉时效的角度来分析。
一、追诉时效的基本规定
根据《中华人民共和国刑法》的规定，犯罪经过一定的期限后，不再追诉。具体期限根据犯罪的法定最高刑来确定：
- 法定最高刑为不满五年有期徒刑的，经过五年；
- 法定最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，经过十年；
- 法定最高刑为十年以上有期徒刑的，经过十五年；
- 法定最高刑为无期徒刑、死刑的，经过二十年。如果二十年以后认为必须追诉的，须报请最高人民检察院核准。
二、挂案超三年的处理
若案件已过追诉时效：
- 通常情况下，司法机关将不再追究刑事责任。这意味着，如果挂案超过三年，且该案件的法定最高刑对应的追诉时效已过（如法定最高刑为三年以下有期徒刑，则追诉时效为五年，但此处“超三年”需结合具体罪名判断是否已过时效），那么司法机关通常会撤销案件，或对于已移送审查起诉的作出不起诉决定，对于已进入审判阶段的终止审理或宣告无罪。
若案件未过追诉时效：
- 如果挂案超过三年，但根据该案件的法定最高刑，追诉时效尚未届满，那么司法机关仍应继续侦查、审查起诉或审判。
特殊情形：
- 发现新犯罪事实或证据：在追诉期限内又发现新的犯罪事实或证据的，追诉期限可能会重新计算或延长。
- 共同犯罪中的部分人超期：在共同犯罪中，如果部分犯罪人的追诉期已过，但其他犯罪人的追诉期尚未届满，那么对其他犯罪人仍应追究刑事责任。
- 逃避侦查或审判：如果犯罪嫌疑人在人民检察院、公安机关、国家安全机关立案侦查或者在人民法院受理案件以后，逃避侦查或者审判的，不受追诉期限的限制。
- 应立案而未立案：被害人在追诉期限内提出控告，人民法院、人民检察院、公安机关应当立案而不予立案的，也不受追诉期限的限制。
三、建议
- 咨询专业律师：由于追诉时效的计算和案件处理程序涉及复杂的法律规定，建议您咨询专业律师，以获取针对您具体案件的法律意见。
- 关注案件进展：如果您是案件当事人或相关利益方，应密切关注案件的进展情况，及时与司法机关沟通。
- 维护自身权益：在案件处理过程中，您有权维护自己的合法权益，包括申请复议、提起诉讼等。
综上所述，刑事案件挂案超三年的处理需结合追诉时效、案件性质、情节严重程度以及是否存在特殊情形等因素来综合判断。希望以上解答能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时咨询。