针对您提出的“刑事案件3年后怎么处理”这一问题，我们需要根据案件所处的不同阶段来具体分析。
一、案件仍在侦查阶段
若刑事案件在立案后三年仍处于侦查阶段，这可能是由于案件复杂、证据收集困难等原因导致的。在此情况下，您可以：
- 联系办案机关：主动与办案机关取得联系，了解案件的进展情况。
- 督促侦查进度：在了解案件进展后，若认为侦查进度过慢，可以合法、合理的方式督促办案机关加快侦查进度。
- 了解法律期限：根据《刑事诉讼法》，侦查羁押期限一般有限制，但复杂案件经批准可延长。您可以了解相关法律规定，确保办案机关在法律允许的范围内进行侦查。
二、案件已移送审查起诉
若案件已移送至检察院进行审查起诉，但三年仍未有结果，您可以：
- 了解检察院决定：首先了解检察院是否已作出起诉或不起诉的决定。
- 反映超期情况：若检察院超期未作出决定，您可以向检察院的上级机关反映情况，要求其督促检察院尽快作出决定。
三、案件已进入审判阶段
若案件已进入法院审判阶段，但三年仍未判决，您可以：
- 了解审判进度：主动与法院联系，了解案件的审判进度和原因。
- 合法反映问题：若认为法院审判进度过慢或存在其他问题，您可以通过合法途径向法院或相关监督部门反映问题。
四、关于取保候审超期的情况
若您或相关人员在案件中被取保候审，且取保候审期限已超过三年，这严重违反了取保候审最长期限12个月的法律规定。在此情况下，您可以：
- 要求解除取保候审：主动联系办案机关，要求解除取保候审措施。
- 申请国家赔偿：若因超期取保候审导致权益受损，您可以依法申请国家赔偿。
五、维护合法权益
若您认为侦查、检察、审判机关存在违法违规行为，您可以：
- 向监督部门申诉：向相关监督部门申诉，维护自身合法权益。
- 寻求法律援助：若需要，您可以寻求专业律师的法律援助，以更好地维护自身权益。
综上所述，刑事案件3年后的处理方式取决于案件所处的不同阶段。您应主动与办案机关联系，了解案件进展情况，并依法维护自身权益。同时，若发现办案机关存在违法违规行为，应及时向相关监督部门申诉。