关于您提出的“子女在单位工作，但子女户口落在农村爷爷户口本上是否合法”的问题，这主要涉及到我国户籍管理制度的相关规定。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，户籍的迁移和落户需要遵循一定的法律法规和政策规定。在我国，户籍管理主要由公安机关负责，并受到相关法律法规的严格规范。

针对您的情况，子女在单位工作，通常意味着子女已经具备了城镇户口或至少是在城镇有稳定的工作和居住地。然而，子女选择将户口落在农村爷爷的户口本上，这主要涉及到的是户口的投靠和迁移问题。

1. 户口投靠政策：

   • 根据我国户籍管理的相关规定，未成年子女可以投靠父母落户，这是常见的户口迁移情形。
   • 对于成年子女，如果符合特定条件（如父母年迈、身边无子女照顾等），也可能允许投靠父母落户，但具体政策因地区而异。
   • 在您的情况下，如果子女已经成年且在单位工作，他们通常不具备直接投靠农村爷爷落户的常规条件。

2. 特殊情形下的户口迁移：

   • 某些地区可能对于特定情况下的户口迁移有特殊规定，比如农村地区的“回迁”政策，但这通常要求申请人具备农村集体经济组织成员资格或满足其他特定条件。
   • 如果子女想要将户口迁回农村，他们可能需要满足当地的具体政策要求，如拥有农村房屋产权、在城镇无住房等，并且需要经过相关部门的审批。

3. 合法性判断：

   • 在没有具体政策支持的情况下，子女在单位工作却将户口落在农村爷爷户口本上，可能不符合常规的户口迁移规定。
   • 然而，如果当地有特殊政策允许此类迁移，并且子女满足了所有相关条件，那么这种迁移就是合法的。

4. 建议：

   • 为了确定这种户口迁移是否合法，建议您咨询当地公安机关或户籍管理部门，了解具体的政策规定和审批流程。
   • 如果子女确实有将户口迁回农村的需求，他们应该积极了解并满足当地的相关政策要求，以便合法地进行户口迁移。

综上所述，子女在单位工作却将户口落在农村爷爷户口本上是否合法，取决于当地的具体政策规定和审批流程。为了获得准确的答案，建议您直接咨询当地相关部门。