结论：店里查到假烟且假烟已被拿走一个多月后，是否还会被罚款取决于多个因素，包括执法部门的调查进度、是否已作出行政处罚决定以及是否存在法定免罚情形等。以下从不同角度为您详细分析：

1. 行政处罚的时效性

• 一般规定：根据《行政处罚法》的相关规定，行政机关在发现违法行为后，通常应在一定期限内（如两年内）作出行政处罚决定。但这一期限并非绝对，具体取决于违法行为的性质、情节以及执法部门的调查进度。
• 假烟案件的特殊性：对于销售假烟等违法行为，由于可能涉及公共安全、消费者权益保护等重大利益，执法部门往往会加快调查和处理进度。因此，即使假烟已被拿走一个多月，如果执法部门仍在调查中或尚未作出处罚决定，您仍可能面临罚款。

2. 是否已作出行政处罚决定

• 已作出决定：如果执法部门在假烟被拿走后的一段时间内（包括一个多月后）已经作出了行政处罚决定，并明确规定了罚款金额和缴纳期限，那么您需要按照决定书的要求缴纳罚款，否则可能面临加处罚款、强制执行等法律后果。
• 未作出决定：如果执法部门尚未作出行政处罚决定，那么您是否会被罚款将取决于后续的调查结果和执法部门的判断。在此期间，您应积极配合执法部门的调查，如实说明情况，以争取从轻或减轻处罚。

3. 法定免罚情形

• 免罚条件：根据《行政处罚法》及相关法律法规的规定，如果存在某些法定免罚情形（如违法行为轻微并及时纠正、没有造成危害后果等），执法部门可能不会对您处以罚款。
• 假烟案件的免罚可能性：在销售假烟的案件中，免罚的可能性相对较低，因为销售假烟通常会对消费者健康和市场秩序造成较大危害。但是，如果您能够证明自己是在不知情的情况下销售了假烟，或者能够提供其他有力证据证明自己无过错或过错较轻，那么您仍有可能争取到免罚或减轻处罚的结果。

4. 后续行动建议

• 积极配合调查：无论是否会被罚款，您都应积极配合执法部门的调查工作，如实说明情况，提供相关证据和资料。
• 咨询专业意见：如果您对执法部门的调查结果或处罚决定有异议，或者想了解更多关于销售假烟的法律后果和应对策略，建议您及时咨询专业律师（比如我）的意见。
• 加强合规管理：为了避免类似情况再次发生，您应加强店内的合规管理，确保所销售的商品均为合法来源、质量合格的产品。

最后，店里查到假烟且假烟已被拿走一个多月后是否还会被罚款，取决于多个因素的综合考量。如果您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。