结论：为了阻止超市员工偷东西，签订协议书的方式并非最佳或合法途径，且可能引发一系列法律问题。以下从多个角度进行分析：

一、协议书的法律效力与限制

1. 协议内容合法性：

   • 协议书的内容必须合法，不得违反法律法规的强制性规定。若协议中包含对员工隐私权的侵犯、不合理的惩罚措施等，则该协议可能因违法而无效。
   • 例如，协议中若规定“员工偷窃将处以高额罚款，且罚款金额远超实际损失”，这样的条款可能因违反《劳动合同法》中关于用人单位不得随意罚款的规定而无效。

2. 协议签订自愿性：

   • 协议书的签订必须基于双方自愿原则。若超市以不签订协议就解雇员工等威胁手段迫使员工签订，则该协议可能因非自愿而无效。

二、更合适的防损措施

1. 完善内部管理制度：

   • 超市应建立完善的内部管理制度，包括明确的员工行为规范、偷窃行为的处罚措施等，并通过培训等方式确保员工知晓并遵守。
   • 例如，可以制定《员工手册》，明确规定偷窃行为的定义、处罚措施及申诉流程等。

2. 安装监控设备：

   • 在超市内安装监控设备，对关键区域进行实时监控，可以有效震慑和防范偷窃行为。
   • 监控设备的安装应遵守相关法律法规，如《个人信息保护法》等，确保不侵犯员工和顾客的隐私权。

3. 加强员工培训与教育：

   • 定期对员工进行职业道德和法律法规培训，提高员工的法律意识和道德水平，减少偷窃行为的发生。
   • 培训内容可以包括职业道德规范、法律法规解读、案例分析等。

三、签订协议书可能引发的法律问题

1. 劳动争议风险：

   • 若协议中包含不合理的条款或处罚措施，员工可能因此提起劳动争议仲裁或诉讼，要求确认协议无效或撤销相关条款。
   • 这将给超市带来不必要的法律纠纷和成本支出。

2. 侵犯员工权益风险：

   • 协议中若包含侵犯员工隐私权、名誉权等权益的条款，员工可能因此提起侵权诉讼，要求超市承担侵权责任。
   • 例如，协议中若规定“员工需接受不定期搜身检查”，这样的条款可能因侵犯员工隐私权而无效。

建议：超市应采取合法、合理的防损措施，如完善内部管理制度、安装监控设备、加强员工培训与教育等，而不是通过签订协议书的方式来试图阻止员工偷东西。若超市发现员工有偷窃行为，应及时收集证据并按照法律法规和内部管理制度进行处理，必要时可寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。