是的，从轻减轻条款在适用时确实遵循“从旧兼从轻”原则。这一原则在刑法适用中至关重要，它确保了法律的稳定性、公正性，并充分保护了被告人的合法权益。以下是对这一原则的详细解释：

一、“从旧兼从轻”原则的基本含义

“从旧兼从轻”原则，简而言之，就是在处理一个行为时，首先应依据行为当时有效的法律（旧法）。然而，如果裁判时的法律（新法）不认为该行为是犯罪，或者规定的处罚较轻，则应当适用新法。这一原则的核心在于以“有利于行为人”为判断标准，确保被告人不会因法律的变更而遭受不利。

二、“从旧兼从轻”原则的具体适用情形

1. 旧法不认为是犯罪，新法认为是犯罪：

   • 在这种情况下，应适用旧法，即不认定为犯罪。这是基于法不溯及既往的原则，保障公民对法律的合理预期和人权。不能用事后生效的新法去评价过去的行为。

2. 旧法认为是犯罪，新法不认为是犯罪：

   • 此时应适用新法，即不认定为犯罪。这体现了刑法的谦抑性和对被告人有利的原则。当新法不再将某行为视为犯罪时，应遵循新法的规定。

3. 旧法和新法都认为是犯罪，但新法规定的刑罚较轻：

   • 在这种情况下，应比较新旧法的量刑轻重，选择适用处罚较轻的法律。这是为了保障被告人的权益，避免对其施加过重的刑罚。

4. 旧法和新法量刑相同：

   • 当新旧法处罚程度一样时，应优先适用行为发生时的法律，即旧法。这是基于法不溯及既往的基本原理。

三、“从旧兼从轻”原则在司法实践中的意义

1. 保障人权：

   • 该原则尊重了公民的合理预期，保障了公民的基本权利。如果新法对某一行为规定了更重的刑罚，并且这种变化是出乎行为人意料的，按照新的法律来追究其刑事责任就会对行为人产生不公平的结果。而遵循“从旧兼从轻”原则，则能避免这种情况的发生。

2. 维护法律的稳定性和连续性：

   • 法律应当具有稳定性和可预测性，人们基于对行为时既存法律的信赖来安排自己的行为。“从旧兼从轻”原则在一定程度上维护了法律的稳定性和连续性，使得人们在遵守法律时能够有一个相对稳定的预期。

3. 实现刑罚的目的：

   • 刑罚的目的不仅在于惩罚犯罪，更在于教育和改造罪犯。适用对罪犯更为有利的法律，可能会使罪犯感受到法律的公正和人道，从而更愿意接受改造，重新回归社会。

四、实际案例说明

以肖某虚开增值税专用发票案为例，肖某在1997年9月30日前实施了虚开增值税专用发票的行为。当时适用的1979年刑法将此行为按照投机倒把罪论处，处罚较重。而1997年新刑法施行后，将虚开增值税专用发票行为单独定罪，并且法定刑相对较轻。法院在审理此案时，根据“从旧兼从轻”原则，适用了1997年新刑法对肖某进行定罪量刑，体现了新法对该行为的规定处罚较轻，更有利于被告人。

总结来说，“从旧兼从轻”原则在刑法适用中起到了至关重要的作用。它确保了法律的公正实施，同时也充分保护了被告人的合法权益。在具体案件中，应根据实际情况灵活选择适用旧法或新法，以实现法律效果与社会效果的统一。如果您在刑事案件方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。