在破产程序中，企业实际控制人有权对以下事项提出异议：

1. 破产申请的合法性：

   • 实际控制人若认为破产申请不符合法定条件，例如企业并未达到破产界限（即不能清偿到期债务，且资产不足以清偿全部债务或明显缺乏清偿能力），或者破产申请存在其他违法情形，如恶意申请破产以逃避债务等，实际控制人有权提出异议。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国企业破产法》的相关规定，破产申请需满足特定条件，实际控制人作为企业的重要利益相关者，有权对申请的合法性进行质疑。

2. 管理人的选任与履职：

   • 实际控制人若对法院指定的管理人选任有异议，认为管理人存在利害关系可能影响公正履职，或者对管理人在破产程序中的具体履职行为（如资产处置、债权审查等）有不满，均有权提出异议。
   • 法律依据：管理人在破产程序中扮演着重要角色，其选任与履职需遵循法定程序与原则，实际控制人作为监督方，有权对管理人的行为提出质疑。

3. 破产财产的评估与处置：

   • 实际控制人若认为破产财产的评估价值不合理，或者对财产的处置方式（如拍卖、变卖等）有异议，认为存在低价处置、损害债权人利益等情形，可以提出异议。
   • 法律依据：破产财产的评估与处置需遵循公平、公正、公开的原则，实际控制人作为企业财产的重要关联方，有权对财产处置过程进行监督并提出异议。

4. 债权申报与确认：

   • 实际控制人若对债权人申报的债权有异议，认为债权不存在、金额不准确或者存在其他违法情形，可以在破产程序中提出异议，并要求法院或管理人进行审查。
   • 法律依据：债权的申报与确认是破产程序中的重要环节，直接关系到债权人的利益分配，实际控制人作为企业的重要利益相关者，有权对债权的真实性、合法性进行质疑。

5. 破产程序的终结与剩余财产分配：

   • 实际控制人若认为破产程序终结的条件未成就，或者对剩余财产的分配方案有异议，认为存在不公平、不合理等情形，可以提出异议并要求法院进行审查。
   • 法律依据：破产程序的终结与剩余财产分配需遵循法定程序与原则，实际控制人作为企业财产的重要关联方，有权对终结条件与分配方案进行监督并提出异议。

法律建议：

• 实际控制人在提出异议时，应确保异议内容具体、明确，并提供相关证据支持其主张。
• 异议应通过合法途径提出，如向法院提交书面异议申请，并按照法定程序进行听证、辩论等。
• 实际控制人应密切关注破产程序的进展，及时行使自己的权利，以维护企业及债权人的合法权益。

在实际操作中，如果实际控制人对破产程序中的任何事项有异议，建议及时咨询专业律师，以便更准确地理解法律规定，更有效地维护自身权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。