企业违法占地的问题，主要由县级以上人民政府自然资源主管部门、县级农业农村主管部门以及乡（镇）政府或街道办事处进行管理和查处。以下是对各部门具体职责和行动措施的详细解释：

1. 县级以上人民政府自然资源主管部门

   • 主要职责：作为土地管理的核心部门，自然资源主管部门负责全面监督土地使用情况，对未经批准或骗取批准非法占用土地的行为进行严厉查处。这包括企业未经许可擅自占用土地进行建设或开发等行为。
   • 法律依据：根据《土地管理法》的相关规定，自然资源主管部门具有责令退还土地、限期拆除违法建筑、没收地上建筑物以及处以罚款等行政处罚权力。
   • 行动措施：自然资源主管部门会组织专业巡查队伍定期开展土地巡查，及时发现并制止违法占地行为；同时，建立严格的土地审批制度，确保每一块土地的使用都经过合法审批；此外，还完善土地违法举报机制，鼓励公众积极参与监督。

2. 县级农业农村主管部门

   • 主要职责：农业农村主管部门专注于农村宅基地的管理，特别是查处农村村民非法占用土地建住宅的行为。虽然主要针对的是农村村民，但企业如果非法占用农村宅基地或相关土地进行建设，同样会受到该部门的查处。
   • 法律依据：随着机构改革的深入，宅基地管理职能已明确转移至农业农村部门。该部门有权依据相关法律法规责令违法者退还土地，并限期拆除新建房屋。
   • 行动措施：农业农村主管部门会对农村宅基地使用情况进行全面调查和登记，建立详细的宅基地管理档案；同时，加强宅基地使用的宣传和教育，提高村民（以及企业）的法律意识和规划意识，引导其合规使用土地。

3. 乡（镇）政府或街道办事处

   • 主要职责：作为基层管理单位，乡（镇）政府或街道办事处积极参与土地违法案件的查处与处理，是土地管理不可或缺的一部分。它们能够及时发现并上报企业违法占地行为，并协助上级部门进行查处。
   • 法律依据：虽然主要执法权集中在县级以上部门，但部分省份已将部分县级部门的行政处罚权下放至乡镇和街道，使其在法律框架内具备相应的执法权限。
   • 行动措施：乡（镇）政府或街道办事处会加强执法力量建设，提高执法人员的专业素质和能力；同时，建立完善的执法制度和流程，确保每一起土地违法案件都能得到及时、公正的处理。

法律建议：

• 如果企业面临违法占地的指控或怀疑自身存在违法占地行为，应立即停止相关活动，并主动与当地自然资源主管部门或农业农村主管部门联系，了解具体情况并寻求指导。
• 企业应加强内部合规管理，确保所有土地使用活动都经过合法审批，并遵守相关法律法规和政策要求。
• 如果企业认为自身权益受到侵害或存在争议，可以寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自身合法权益。

可能的法律后果：

• 如果企业被查实存在违法占地行为，可能会面临责令退还土地、限期拆除违法建筑、没收地上建筑物以及处以罚款等行政处罚。
• 在严重情况下，企业还可能面临刑事责任追究，如非法占用农用地罪等。

因此，企业应严格遵守土地管理法律法规和政策要求，确保所有土地使用活动都合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。