关于公司收购公寓用于长期做民宿是否违法的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况来综合判断。以下是我从不同角度为你进行的分析：
土地用途与规划许可：
- 首先，需要确认公寓所在的土地用途是否允许用于民宿经营。如果土地用途规划为住宅用地，而未经批准擅自改变为商业用途（如民宿），则可能违反土地管理法和城乡规划法的相关规定。
- 即便土地用途允许商业经营，也需要确认该公寓是否具备作为民宿经营所需的规划许可和消防安全等条件。
房屋产权与租赁关系：
- 如果公司是通过购买方式获得公寓产权，那么需要确保产权清晰，无纠纷。
- 如果公司是通过租赁方式获得公寓使用权，那么需要审查租赁合同，确认租赁期限、用途等条款是否允许用于民宿经营。同时，也要确保出租方有权出租该公寓，且租赁行为不违反相关法律法规。
民宿经营许可：
- 民宿经营通常需要获得相关的经营许可，如旅馆业特种行业许可证、公共卫生许可证等。公司需要确保已经获得这些必要的许可，否则可能构成非法经营。
税务与财务合规：
- 民宿经营还需要遵守税务和财务方面的法律法规，如按时申报纳税、保持财务记录清晰等。公司需要确保在税务和财务方面做到合规，避免因此产生法律风险。
其他法律法规：
- 除了上述方面外，还需要考虑其他可能适用的法律法规，如消费者权益保护法、旅游法等。公司需要确保在民宿经营过程中遵守这些法律法规，保护消费者的合法权益。
可能面临的法律后果：
- 如果公司未经批准擅自改变土地用途或房屋用途，可能面临土地管理部门的处罚，包括罚款、责令恢复原状等。
- 如果公司未获得必要的经营许可或违反税务、财务等方面的法律法规，可能面临相关部门的处罚，甚至可能被吊销营业执照或面临刑事责任。
建议：
- 在决定收购公寓用于民宿经营之前，公司应进行充分的法律尽职调查，确认土地用途、房屋产权、租赁关系、经营许可等方面的合规性。
- 在经营过程中，公司应严格遵守相关法律法规，确保税务、财务等方面的合规性，并保护消费者的合法权益。
- 如果遇到法律问题或不确定的情况，建议及时咨询专业律师，以避免潜在的法律风险。
总结来说，公司收购公寓用于长期做民宿是否违法，取决于多个因素的综合判断。在做出决策之前，公司应进行充分的法律尽职调查，并确保在经营过程中遵守相关法律法规。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。