核心结论：入股合同到期后，若约定大股东继续经营、小股东退股，小股东退股方式需结合合同条款、公司章程及法律规定综合判断，具体分以下情况处理：

1. 优先按合同约定退股

若入股合同中明确约定了退股的具体方式（如股权回购价格、支付期限、回购方等），则双方应按合同履行。例如：

• 回购主体：合同可能约定由大股东或公司回购小股东股权；
• 回购价格：可能约定按出资额、净资产比例或评估值计算；
• 支付方式：可能约定一次性支付或分期支付。

注意：若合同约定由公司回购股权，需符合《公司法》第74条或第142条规定的情形（如异议股东回购请求权），否则可能因违反资本维持原则被认定无效。

2. 合同未约定或约定不明时的处理

若合同未明确退股方式，需按以下步骤处理：

（1） 协商确定退股方案

双方可协商确定股权转让价格、支付方式等，并签订补充协议。协商时需注意：

• 股权价值评估：建议委托第三方机构评估公司净资产，以确定合理价格；
• 优先购买权：若其他股东（如大股东）行使优先购买权，需按《公司法》第71条处理；
• 公司减资：若无人受让股权，可考虑公司减资，但需履行法定程序（如通知债权人、公告等）。

（2） 通过股东会决议退股

若协商不成，可提议召开股东会，通过决议明确退股方案。但需注意：

• 表决权比例：有限责任公司需代表三分之二以上表决权的股东通过；
• 异议股东权利：若小股东对决议投反对票，可依据《公司法》第74条要求公司回购股权（需符合法定情形）。

（3） 诉讼或仲裁解决

若仍无法达成一致，小股东可向法院起诉或依据仲裁条款申请仲裁，要求：

• 确认退股权利：请求法院判决大股东或公司履行回购义务；
• 赔偿损失：若因大股东或公司原因导致退股受阻，可要求赔偿损失。

3. 特殊情形下的退股限制

若公司存在以下情形，小股东退股可能受限：

• 公司亏损：若公司净资产为负，股权可能无实际价值；
• 未履行出资义务：若小股东未足额出资，需先补足出资才能退股；
• 竞业限制：若合同约定退股后需遵守竞业限制，小股东需履行相关义务。

建议：退股涉及复杂法律程序，建议小股东在操作前：

1. 仔细审查入股合同及公司章程；
2. 委托律师评估退股可行性及风险；
3. 保留相关证据（如合同、付款凭证、股东会决议等）。

若有进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合具体案情为您提供详细解答。