在处理确权问题时，究竟是以1998年的土地合同为主，还是以2022年的合同为主，这并非一个简单的是非问题，而是需要依据具体情况和法律规定来综合判断。以下是我从不同角度为你进行的分析：

一、新合同明确取代旧合同的情况

如果2022年的合同中明确声明了自其生效之日起，1998年的合同即行废止，或者明确指出了以新合同为准，那么在这种情况下，2022年的合同将具有更高的法律效力，确权时应以新合同为主。这是因为新合同作为双方最新的意思表示，其明确取代旧合同的条款是合法有效的，反映了双方最新的协商结果和意愿。

二、新合同与旧合同内容冲突的情况

1. 一般原则：如果2022年的合同与1998年的合同在关键条款上存在冲突，如土地权属、使用期限、用途等，且没有特别约定以哪份合同为准，那么一般应以2022年的合同为准。因为新合同反映了双方最新的意思表示和协商结果，是双方对原合同内容的更新或修正。

2. 部分有效情形：如果1998年的合同中存在一些与2022年合同不冲突的内容，如土地的具体位置、面积等，且这些内容不违反法律规定和新合同的整体精神，那么这些部分仍然保持有效。在确权时，应综合考虑两份合同的内容，确保权属的清晰和准确。

三、新合同未涉及旧合同内容的情况

如果2022年的合同只是对1998年合同的部分事项进行了调整或补充，而未涵盖旧合同的全部内容，那么1998年合同中未被新合同涉及的部分将继续有效。例如，如果新合同仅对土地的使用期限进行了延长，而未涉及土地权属、用途等其他事项，那么旧合同中关于这些事项的约定仍然有效。在确权时，应分别依据两份合同的相关内容进行判断。

四、法律规定或当事人另有约定的情况

1. 特殊规定影响效力：在某些特定情况下，法律的特殊规定可能影响合同的效力。例如，如果法律对土地合同的变更或废止有特别规定，那么应遵循这些规定来处理确权问题。

2. 特别约定优先：如果当事人在2022年的合同中明确约定了1998年的合同在某些特定情况下仍然有效，且该约定不违反法律强制性规定和公序良俗，那么旧合同将按约定保持部分或全部效力。在确权时，应尊重当事人的特别约定，确保权属的合法性和稳定性。

法律建议

1. 仔细审查合同内容：在处理确权问题时，应仔细审查两份合同的内容，特别是关于土地权属、使用期限、用途等关键条款的约定。

2. 咨询专业律师：如果两份合同的内容存在冲突或不明确之处，建议咨询专业律师进行法律分析和判断。律师可以根据具体情况和法律规定，为你提供准确的法律意见和建议。

3. 考虑诉讼或仲裁：如果双方无法就确权问题达成一致意见，可以考虑通过诉讼或仲裁等法律途径来解决争议。在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构将依据法律规定和合同约定来作出裁决，确保权属的清晰和准确。

希望以上分析能对你有所帮助。如果你还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。