在打官司过程中，如果怀疑签名是假的，通常由法院指定的鉴定机构来进行鉴定。以下是对此问题的详细分析：

1. 鉴定机构的指定：

   • 在诉讼过程中，如果一方对另一方提供的文件上的签名真实性提出质疑，法院会根据当事人的申请或依职权决定进行笔迹鉴定。
   • 鉴定机构通常由法院从具有相应资质的鉴定机构名录中随机选择，以确保鉴定的公正性和专业性。

2. 鉴定流程：

   • 当事人需要向法院提交鉴定申请，并提供相关证据材料，如需要鉴定的文件原件或复印件等。
   • 法院在审查申请后，会决定是否进行鉴定，并指定鉴定机构。
   • 鉴定机构在接受委托后，会按照法定程序进行鉴定，并出具鉴定报告。

3. 鉴定报告的效力：

   • 鉴定报告是法院认定事实的重要依据之一。如果鉴定报告认定签名是假的，那么该文件可能不会被法院采信作为证据。
   • 然而，鉴定报告并非绝对不可推翻。如果一方对鉴定报告有异议，可以申请重新鉴定或提供其他证据来反驳鉴定报告。

4. 当事人的权利与义务：

   • 当事人有权对鉴定机构的选择提出异议，但通常需要在法院指定鉴定机构后的一定期限内提出。
   • 当事人有义务配合鉴定机构的工作，如提供必要的鉴定材料、参加鉴定过程等。

5. 实际操作建议：

   • 如果您怀疑签名是假的，应及时向法院提出鉴定申请，并提供相关证据材料。
   • 在鉴定过程中，保持与鉴定机构的沟通，了解鉴定进展和可能需要的额外材料。
   • 对鉴定报告进行仔细审查，如有异议，及时在法定期限内提出并申请重新鉴定或提供其他反驳证据。

总结来说，在打官司过程中，如果怀疑签名是假的，应由法院指定的鉴定机构进行鉴定。当事人应积极配合鉴定工作，并对鉴定报告进行仔细审查，如有异议及时提出。如果您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。