关于镇长签字并盖有镇社会治安综合治理委员会公章的搬迁协议是否有效的问题，需分情况讨论：

1. 协议主体与权限问题

   • 有效情形：若镇长作为镇政府的法定代表人，在镇政府授权范围内代表镇政府签署搬迁协议，且镇社会治安综合治理委员会的公章使用符合镇政府内部管理规定（如公章使用权限已明确涵盖此类协议签署），则该协议在主体和权限上具备合法性，协议有效。
   • 无效情形：若镇长超越职权范围签署协议（如未经镇政府授权擅自处置集体土地或房屋），或镇社会治安综合治理委员会的公章使用超出其职能范围（如该委员会仅负责治安综合治理，无权签署拆迁补偿协议），则协议可能因主体不适格或权限瑕疵而无效。

2. 协议内容合法性

   • 有效情形：协议内容符合《土地管理法》《国有土地上房屋征收与补偿条例》等法律法规的规定（如补偿标准合理、程序合法、未侵犯被拆迁人合法权益），则协议内容合法，协议有效。
   • 无效情形：若协议内容存在以下情形，则协议无效：
     • 补偿标准低于法定最低标准；
     • 未履行法定程序（如未公告、未听取被拆迁人意见）；
     • 存在欺诈、胁迫、显失公平等情形；
     • 违反法律、行政法规的强制性规定。

3. 公章效力问题

   • 有效情形：若镇社会治安综合治理委员会的公章系真实、合法使用，且该委员会在镇政府内部具有签署此类协议的权限（如通过镇政府文件或内部规定明确授权），则公章效力可支持协议有效性。
   • 无效情形：若公章系伪造、变造，或该委员会无权使用公章签署此类协议（如公章使用权限未涵盖拆迁补偿协议），则公章效力存疑，协议可能无效。

法律建议：

• 若您是协议签署方之一，建议核实镇长的授权范围、镇社会治安综合治理委员会的公章使用权限，以及协议内容是否符合法律法规规定。
• 若您对协议效力存疑，可要求镇政府出具书面授权文件或公章使用规定，以确认协议主体和权限的合法性。
• 若协议内容存在违法情形，您有权拒绝签署或要求修改协议内容，必要时可依法维权。

可能法律后果：

• 若协议有效，双方应按协议约定履行义务，否则可能承担违约责任。
• 若协议无效，双方应返还因协议取得的财产，无法返还的应折价补偿，有过错的一方应赔偿对方因此受到的损失。

如有进一步疑问或需具体法律分析，可直接向我咨询。