科研项目验收不合格是否要追回，需根据具体情况判断，主要涉及合同约定、法律规定及实际损失情况。以下从不同角度进行分析：
合同约定角度：
- 若科研项目合同中明确约定了验收不合格的处理方式，如追回已支付款项、要求返还已交付的成果或承担违约责任等，则应按照合同约定执行。
- 合同是双方意思表示一致的产物，具有法律约束力。因此，在合同有明确约定的情况下，验收不合格的处理方式应遵循合同条款。
法律规定角度：
- 根据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规，若科研项目验收不合格是由于承包方（或科研服务提供方）的原因造成的，发包方（或科研服务需求方）有权要求承包方承担违约责任，包括但不限于赔偿损失、继续履行、采取补救措施等。
- 若验收不合格导致合同目的无法实现，发包方还有权解除合同，并要求承包方返还已支付的款项或赔偿因此造成的损失。
实际损失情况角度：
- 在决定是否追回时，还需考虑实际损失情况。若验收不合格导致的损失较小，且通过补救措施可以弥补，双方可能协商不追回或部分追回。
- 若损失较大，且无法通过补救措施弥补，发包方则有权要求全额追回已支付的款项，并要求承包方承担额外的赔偿责任。
具体建议：
- 审查合同条款：首先，应仔细审查科研项目合同中的相关条款，特别是关于验收不合格的处理方式、违约责任等约定。
- 评估损失情况：其次，对验收不合格导致的实际损失进行评估，包括直接损失和间接损失。
- 协商与诉讼：根据合同条款和损失情况，与承包方进行协商，寻求妥善解决方案。若协商无果，可考虑通过法律途径解决争议，如提起诉讼或申请仲裁。
可能后果：
- 若发包方决定追回款项或要求赔偿，而承包方拒绝履行，则可能面临法律诉讼或仲裁程序，增加双方的时间和成本投入。
- 若承包方能够积极配合发包方进行补救或赔偿，则可能避免法律纠纷，维护双方的良好合作关系。
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