结论：保险公司不一定会拒赔，是否理赔取决于保险合同条款、事故具体情况以及保险公司的核赔政策，需分情况讨论。以下是具体分析：

1. 保险合同条款是核心依据

• 基础责任范围：若保险合同（如交强险、商业三者险）未将“驾驶人违法行为”列为免责事由，即使事故证明未明确驾驶人是否存在违法行为，保险公司仍需按合同约定承担赔偿责任。例如，交强险的赔偿原则是“无过错责任”，除非存在故意制造事故等法定免责情形。
• 免责条款的效力：若合同中明确约定“驾驶人存在超速、酒驾等违法行为时保险公司免责”，则需进一步分析：
  • 违法行为是否被证实：若事故证明“无法确定”违法行为，但其他证据（如监控、证人证言）能证明驾驶人存在违法行为，保险公司可能拒赔；
  • 举证责任分配：保险公司需证明违法行为与事故存在因果关系，若无法举证，仍需理赔。

2. 事故证明的“不确定性”不影响理赔的情形

• 损失与违法行为无关：即使驾驶人存在违法行为（如未系安全带），但事故损失是由第三方碰撞导致，与违法行为无直接关联，保险公司通常需理赔。
• 保险类型差异：
  • 交强险：以“填补损失”为原则，除非驾驶人故意制造事故，否则一般需赔偿；
  • 商业险：若合同未明确免责，保险公司需理赔；若明确免责，需结合证据判断是否适用。

3. 保险公司可能拒赔的情形

• 存在重大违法行为嫌疑：若事故现场痕迹、证人证言等间接证据指向驾驶人存在酒驾、逃逸等行为，即使事故证明未明确，保险公司可能以“怀疑存在免责情形”为由暂缓赔付，并要求进一步调查。
• 驾驶人未配合调查：若驾驶人拒绝酒精检测、逃逸等，导致违法行为无法查实，保险公司可能依据合同条款（如“未如实告知义务”）拒赔。

4. 实务建议

• 及时固定证据：若事故证明未明确违法行为，建议保留现场照片、监控录像、证人联系方式等，以备后续举证；
• 审阅保险合同：重点查看“责任免除”条款，确认是否存在与违法行为相关的免责约定；
• 协商或诉讼：若保险公司拒赔，可先协商要求书面说明拒赔理由；若协商无果，可通过诉讼或仲裁解决，法院会综合证据和合同条款判决。

总结：事故证明的“不确定性”不直接导致拒赔，关键在于保险合同条款和证据链的完整性。若您遇到具体案件，可提供保险合同、事故证明等材料，我会进一步分析理赔可能性。