营运车辆在交通事故中即使负主要责任，也有权主张停运费，该费用属于因事故导致的间接损失，应按照责任比例由对方（次要责任方）分担。以下从多个角度为你详细分析：

一、法律依据

1. 《中华人民共和国民法典》：该法明确规定，当营运车辆因事故导致停运时，责任方需对由此产生的经济损失负责。这是主张停运费的基本法律依据。
2. 《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第十二条：该条款明确指出，因道路交通事故造成依法从事货物运输、旅客运输等经营性活动的车辆无法从事相应经营活动所产生的合理停运损失，当事人请求侵权人赔偿的，人民法院应予支持。这一条款直接支持了营运车辆主张停运费的请求。

二、停运费的定义与性质

停运费是交通事故导致的间接损失，它指的是营运车辆因事故维修等合理期间内无法从事正常运营活动所遭受的收入减少。这种损失是客观存在的，且只要对方对事故发生存在过错，就应按责任比例分担此损失。

三、停运费的计算

1. 计算基础：停运费基于车辆实际的误工收入和停运时间来计算。误工费计算公式为：务工收入 × 误工天数。
2. 务工收入的确定：
   • 若车辆有固定的营运收入，根据停运时间直接计算损失金额。例如，一辆货车每月固定收入为2万元，因事故停运1个月，则停运费为2万元。
   • 若车辆无固定营运收入，可参考相同或相近行业车辆的平均营运收入来计算。这通常需要借助行业数据或专业评估来确定。

四、主张停运费的条件与证据

1. 条件：车辆必须为合法的营运车辆，持有营运证等相关证件。这是主张停运费的前提条件，因为只有合法营运的车辆才能产生合法的停运损失。
2. 证据：提供营运合同、收入流水、停运时间证明等材料，以证明停运期间实际减少的收入情况。这些证据是主张停运费的关键，它们能够直接证明你的损失金额和停运时间。

五、赔偿流程

1. 协商：首先向侵权人（即主要责任方中的对方，此处你为主要责任方，但对方也有次要责任）提出赔偿要求，并就停运损失的数额进行协商。协商是解决纠纷的一种快速且成本较低的方式。
2. 诉讼：若协商不成，可通过诉讼方式向人民法院提起诉讼，请求判决侵权人赔偿停运损失。法院会委托鉴定评估机构对停运损失进行评估，并根据评估结果作出判决。诉讼是解决纠纷的一种最终且具有强制力的方式。

六、特殊情况处理

1. 交强险赔付：若对方车辆有交强险，保险公司需在无责限额内进行赔付。但需要注意的是，交强险的赔付范围有限，可能无法完全覆盖你的停运损失。
2. 商业险赔付：对于超出交强险无责限额的部分，若对方车辆投保了商业三者险，需依据商业险合同条款来确定是否给予赔偿。商业险的赔付范围和条件通常更加灵活和广泛，但也需要根据具体合同条款来确定。

总结与建议：营运车辆在交通事故中即使负主要责任，也有权主张停运费。为了顺利获得赔偿，你需要准备充分的证据来证明你的损失金额和停运时间，并按照规定的赔偿流程进行操作。如果你在处理过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。