您好，关于“项目罚款员工是否违法”的问题，这确实不是一个简单的合法或非法就能判断的，而是需要根据具体情况来综合分析。
首先，从一般情况来看，企业是没有罚款权的。自2008年《企业职工奖惩条例》废止后，我国现行的法律、法规并没有明确赋予用人单位对员工的罚款权。罚款属于行政处罚的范畴，而根据《行政处罚法》，只有具有行政处罚权的行政机关或者经过授权、委托的组织才有权实施罚款。用人单位并不是行政机关，因此不具备罚款的资格。
然而，也存在一些特殊情形，使得用人单位对员工进行罚款可能合法。这主要包括两种情况：
基于合同约定：如果劳动合同中明确约定了，劳动者在违反特定规章制度时需要承担赔偿责任，并且这个约定不违反法律法规的强制性规定和公平原则，那么这种约定可能是有效的。但需要注意的是，赔偿金额必须合理，且在扣除时不得超过劳动者当月工资的20%。如果扣除后的剩余工资低于当地的月最低工资标准，那么用人单位应该按照最低工资标准来支付。
基于民主程序制定的规章制度：如果用人单位依法通过民主程序制定了规章制度，并且这个规章制度的内容合法、合规，已经向劳动者进行了公示，那么规章制度中明确规定的违纪行为对应的经济处罚措施，在合理、公平且符合程序要求的情况下，部分法院在司法实践中可能会认可这种处罚。但这也存在严格的条件限制，并不是所有情况都会被认可。
在实际操作中，用人单位应该尽量避免直接对员工进行罚款，而是应该通过绩效考核、奖励激励等合法、合理的方式来规范员工的行为。如果确实需要涉及赔偿或经济处罚，那么必须确保遵守相关的法律法规，避免侵犯员工的合法权益。
最后，如果您在处理这类问题时遇到不确定的情况，我建议您咨询专业的劳动法律师，以确保您的管理行为既合法又有效。希望这个解答能对您有所帮助！