针对您提出的“基本农田违法建筑乡镇是否可以拆除”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、结论前置
基本农田上的违法建筑，在依法确认并遵循法定程序的前提下，乡镇人民政府是有权进行拆除的。但这一过程必须严格遵守相关法律法规，并考虑特殊情况下的处理方式。
二、法律依据与拆除主体
《中华人民共和国城乡规划法》第六十五条：该条款明确规定，对于未依法取得乡村建设规划许可证或未按其规定建设的建筑，乡、镇人民政府有权责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可以组织拆除。这一规定为乡镇人民政府拆除基本农田上的违法建筑提供了直接的法律依据。
《中华人民共和国土地管理法》：该法指出，对于非法占用土地（包括基本农田）进行建设的行为，县级以上人民政府农业农村主管部门或相关土地管理部门有权责令退还土地并限期拆除新建房屋。虽然直接拆除主体可能并非乡镇人民政府，但在实际操作中，乡镇人民政府往往会在上级部门的指导下或授权下参与拆除工作。
三、拆除程序
拆除基本农田上的违法建筑，必须遵循严格的法定程序，以确保执法的公正性和合法性。这通常包括以下几个步骤：
调查取证：乡镇人民政府或相关部门首先会对涉嫌违法建筑进行现场勘查、询问当事人、收集证据材料，以确认建筑是否违法。
责令限期改正：一旦认定为违法建筑，将向当事人下达责令限期改正通知书，明确违法事实、法律依据及改正要求，并告知陈述、申辩权利。
作出行政处罚决定：若当事人未在规定期限内改正，相关部门将依法作出限期拆除决定书，并告知行政复议、诉讼权利。
催告与执行：经催告后，当事人仍不履行拆除义务的，相关部门将作出强制执行决定并公告，最终依法组织强制拆除。在执行过程中，需注意保护当事人的合法财产。
四、特殊情况下的处理
尽管基本农田上的违法建筑原则上可以拆除，但在某些特殊情况下，拆除可能会受到限制或采取其他处理方式。例如：
符合规划且可补办手续：若违法建筑符合土地利用总体规划和乡村建设规划，且可通过补办手续合法化，则可能要求当事人限期补办手续，而非直接拆除。
拆除影响公共利益：若拆除违法建筑会对公共安全、公共交通、公共设施等造成重大影响，相关部门可能采取其他措施处理，如罚款、没收违法所得等，以避免简单拆除带来的不良后果。
五、建议与总结
对于基本农田上的违法建筑问题，我建议您：
及时咨询当地相关部门：了解具体法律法规和政策要求，以便更好地应对和处理。
积极配合政府部门的调查与处理：如果您的建筑被认定为违法建筑，应尽快采取措施进行整改或拆除，以避免不必要的法律风险和损失。
寻求专业法律帮助：在处理过程中，如果遇到复杂的法律问题或争议，建议寻求专业法律帮助以维护自身合法权益。
综上所述，基本农田上的违法建筑在依法确认并遵循法定程序的前提下，乡镇人民政府是有权进行拆除的。但这一过程必须严格遵守相关法律法规，并考虑特殊情况下的处理方式。希望以上解答能对您有所帮助。