结论前置：保安每天工作12小时且实行三班制，在大多数情况下是不合法的，这主要违反了我国关于工作时间和加班时间的法律规定。不过，也存在一些特殊情况，下面我会详细分析。
一、一般情况下的违法性分析
工作时间限制：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时的工时制度。保安每天工作12小时，显然超出了这一法定标准。
加班时间限制：
- 即便考虑到用人单位可能因生产经营需要安排加班，但《劳动法》第四十一条也明确规定了加班时间的上限：一般每日不得超过1小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过3小时，且每月不得超过36小时。保安每天工作12小时，即超出正常工作时间4小时，这远远超过了每日加班不得超过3小时的上限，且按月计算必然远超36小时的加班上限。
休息休假权利：
- 劳动者享有休息休假的权利，这是《劳动法》赋予的基本权益。保安每天工作12小时，且实行三班制，可能意味着他们几乎没有连续的休息时间，这严重侵犯了劳动者的休息权。
二、特殊情况下的合法性考量
不定时工作制或综合计算工时工作制：
- 某些企业因生产经营特点，可申请实行不定时工作制或综合计算工时工作制，但需经劳动行政部门审批。若保安岗位经审批实行这些特殊工时制，且在计算周期内平均日工作时间和平均周工作时间与法定标准基本相同，则可能合法。但即便如此，用人单位也应确保劳动者的休息休假权利，并依法支付加班工资。
偶尔因特殊需要延长工作时间：
- 如果是偶尔因特殊需要而延长工作时间，且未对劳动者造成严重影响，可能不构成严格意义上的违法。但这种情况应当严格控制，并确保不违反《劳动法》关于工作时间和加班时间的基本原则。
三、法律建议与维权途径
与用人单位协商：
- 保安如认为用人单位的工时安排不合理、不合法，有权与用人单位进行协商，要求合理安排工作时间和休息时间，并支付相应的加班工资。
向劳动监察部门投诉：
- 协商不成时，保安可以向当地劳动监察部门投诉举报，劳动监察部门将依法对用人单位的违法行为进行查处。
申请劳动仲裁：
- 保安还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。
四、可能的法律后果
- 如果用人单位违反《劳动法》关于工作时间和加班时间的规定，劳动监察部门将责令其改正，并可能处以罚款。
- 劳动者因用人单位违法行为而遭受损失的，有权要求用人单位承担赔偿责任。
总结：保安每天工作12小时且实行三班制，在大多数情况下是不合法的。用人单位应自觉遵守法律法规，合理安排员工的工作和休息时间，确保员工的身心健康和生产安全。保安等劳动者也应了解自己的权益，并在必要时采取法律手段维护自己的合法权益。如果您有进一步的法律问题或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。