结论：拿了公司的药自己吃，涉及金额二千元，是否会被判刑不能一概而论，需根据具体情况判断，但存在被追究刑事责任的可能性。
分析如下：
法律定性：
- 拿了公司的药自己吃，这一行为可能构成职务侵占罪或盗窃罪，具体取决于行为人的身份和侵占手段。
- 如果行为人是公司员工，利用职务上的便利，将公司财物非法占为己有，数额较大的，构成职务侵占罪。
- 如果行为人不是公司员工，或者虽然身为员工但并未利用职务便利，而是采用秘密窃取的手段，则可能构成盗窃罪。
数额标准与刑事责任：
- 根据《刑法》及相关司法解释，职务侵占罪和盗窃罪的立案标准均涉及数额。对于职务侵占罪，一般数额在六万元以上才达到刑事立案标准（但具体标准可能因地区而异，且存在小额多次侵占累计计算的情况）；对于盗窃罪，一般数额在一千元至三千元以上即达到刑事立案标准。
- 在您描述的情况下，涉及金额二千元，若按盗窃罪的立案标准，已达到刑事立案的起点。但若按职务侵占罪，则可能未达到刑事立案标准（除非存在多次侵占累计计算或地区标准较低的情况）。
量刑情节：
- 即使构成犯罪，量刑也会受到多种因素的影响，如犯罪情节、悔罪表现、退赃情况等。
- 如果行为人能够积极退赃、认罪悔罪，可能获得从轻或减轻处罚的机会。
其他可能性：
- 如果行为人的行为尚未达到刑事立案标准，但违反了公司的规章制度或治安管理规定，可能面临行政处罚或公司内部的纪律处分。
建议：
- 立即停止行为：如果尚未造成更严重的后果，应立即停止侵占行为，并考虑向公司坦白或退还侵占的财物。
- 咨询专业律师：由于法律问题的复杂性，建议直接向我咨询，以便根据具体情况提供更详细的法律分析和建议。
- 了解法律后果：无论是否构成犯罪，都应了解自己行为的法律后果，以便做出明智的决策。
示例说明：
- 假设行为人是公司员工，但并未利用职务便利，而是趁无人注意时偷拿了公司的药，价值二千元。这种情况下，行为人可能构成盗窃罪，面临刑事处罚。
- 假设行为人是公司员工，且利用了职务便利，但侵占的财物价值较低（如二千元），且未达到地区职务侵占罪的立案标准。这种情况下，行为人可能不会面临刑事处罚，但可能受到公司的纪律处分或行政处罚。
总之，拿了公司的药自己吃，涉及金额二千元，是否会被判刑需根据具体情况判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。