结论：公司总经理将钱借给合作公司做投标保证金使用，这一行为是否违法，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 从公司内部管理角度：

   • 公司章程与规定：首先，需要查看公司章程或内部管理规定中是否有关于资金出借、担保或类似行为的明确规定。如果公司章程或规定中明确禁止此类行为，那么总经理的行为就违反了公司内部规定，可能面临公司内部的纪律处分或法律责任。
   • 决策程序：即使公司章程或规定中没有明确禁止，总经理在出借资金前也应遵循公司内部的决策程序，如经过董事会或股东会的批准。如果未经适当程序擅自出借，也可能构成违规。

2. 从法律法规角度：

   • 挪用资金罪：如果总经理利用职务上的便利，将公司资金挪用给合作公司使用，且数额较大、超过三个月未还，或者虽未超过三个月但数额较大、进行营利活动或非法活动，那么可能构成挪用资金罪。但在此案例中，若总经理是出于公司利益考虑，且资金最终用于投标保证金，并未直接用于个人营利或非法活动，且能及时归还，则可能不构成此罪。不过，这需要根据具体证据和法院的判断来确定。
   • 关联交易与利益冲突：如果总经理与合作公司存在关联关系，且出借资金的行为未经过公司适当决策程序批准，可能构成关联交易违规或利益冲突。这取决于公司章程、相关法律法规以及监管机构的要求。

3. 从合同与债权债务角度：

   • 借款合同：如果总经理以个人名义与合作公司签订借款合同，并明确约定了借款金额、期限、利率等条款，那么这构成了一个独立的债权债务关系。在此情况下，总经理需承担还款责任（如果合作公司无法还款），但这一行为本身并不直接违法，除非存在欺诈、高利贷等违法行为。
   • 公司资金与个人资金混同：如果总经理使用公司资金出借给合作公司，但未经公司同意或未按照公司规定程序进行，且事后无法证明该资金为个人资金，那么可能构成公司资金与个人资金的混同，违反公司财务管理规定，甚至可能涉及职务侵占等违法行为。

建议：

• 审查公司章程与规定：首先审查公司章程和内部管理规定，了解是否有关于资金出借的明确规定。
• 遵循决策程序：如果决定出借资金，应确保遵循公司内部的决策程序，如经过董事会或股东会的批准。
• 明确借款性质与条款：如果以个人名义出借资金，应签订明确的借款合同，并保留好相关证据。如果使用公司资金出借，应确保符合公司财务管理规定和法律法规要求。
• 咨询专业意见：在涉及复杂法律问题时，建议咨询专业律师或法律顾问的意见，以确保行为的合法性和合规性。

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