流转农民土地盖厂房是否合法，需分情况讨论，主要取决于土地流转的性质、土地用途以及是否符合相关规划和审批要求。以下是对此问题的详细分析：

1. 土地流转的合法性与性质

   • 根据《中华人民共和国农村土地承包法》，土地承包经营权人有权在合同约定的期限内占有农村土地，并可自主开展农业生产经营活动。土地流转方式包括转包、出租、互换、转让等，且应签订书面合同。若采取转让方式，还需经发包方同意。
   • 农村土地流转通常涉及的是农用地的经营权，这些土地有明确的用途管制，主要用于农业生产。未经法定程序，不得擅自改变其用途用于非农业建设，包括建厂房。

2. 农村建房的合法途径与规划要求

   • 农村村民建房需经过合法审批程序获得宅基地。具体流程包括向农村集体经济组织或村民委员会提出申请，经村民会议或代表会议讨论通过后，由乡镇人民政府审核，再报县级人民政府批准。
   • 建房必须符合乡（镇）土地利用总体规划和村庄规划，不得占用永久基本农田。若流转的土地是农用地，转为建设用地需按照《中华人民共和国土地管理法》办理农用地转用审批手续。未经审批，在农用地上建厂房属于违法行为。

3. 特殊情况下的建房合法性

   • 设施农用地：从事规模化农业生产等建设配套的生产设施、附属设施和配套设施用地（如农业生产看护房），可按规定办理设施农用地相关手续后建设。但需严格遵守用地规模、建设标准等规定，且不得用于居住等非农业生产配套用途。若厂房属于此类设施，且符合相关规定，则可能合法。
   • 集体经营性建设用地入市：若流转的土地属于集体经营性建设用地，且符合土地利用总体规划、城乡规划确定为工业、商业等经营性用途，并经依法登记，土地所有权人可通过出让、出租等方式交由单位或个人使用。使用者可按规定建设经营性房屋等建筑，但需遵循规划、建设审批程序。在此情况下，建厂房可能合法。

4. 法律后果与风险提示

   • 未经审批建厂房：可能面临被责令拆除、罚款等行政处罚，甚至可能涉及刑事责任（如非法占用农用地罪）。
   • 合法流转与建房：即使土地流转和建房行为合法，也需确保合同条款明确、权利义务清晰，以避免后续纠纷。

建议：

• 在流转农民土地盖厂房前，务必了解土地性质、用途以及相关规划和审批要求。
• 咨询当地土地管理部门或规划部门，确认土地是否可用于建厂房，并了解具体的审批流程。
• 签订土地流转合同时，明确约定土地用途、流转期限、权利义务等条款，以避免后续纠纷。

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