企业注销时，法人股东并不一定会随之注销，这两者是独立的法律行为，需分别根据相关法律法规和公司章程进行处理。以下从不同角度为您详细分析：
一、法人股东注销与企业注销的关系
法人股东注销：
- 法人股东注销是指该法人实体（如公司、企业等）因各种原因（如解散、破产等）在工商行政管理部门办理注销登记，从而丧失法人资格的过程。
- 法人股东注销后，其作为股东的身份将不复存在，但其注销前的权利和义务（如股权、债权、债务等）需根据相关法律法规和公司章程进行处理。
企业注销：
- 企业注销是指企业因各种原因（如解散、破产、被撤销等）在工商行政管理部门办理注销登记，从而终止其法人资格的过程。
- 企业注销前，需完成清算工作，包括清理财产、编制资产负债表和财产清单、通知债权人等，以确保企业债务得到妥善处理。
二、法人股东注销对企业的影响及处理措施
股权归属与继承问题：
- 若法人股东在注销前已合法处置其股权（如转让给其他股东或第三方），则按协议执行，不影响企业注销。
- 若法人股东未处置其股权，则需根据具体情况处理。若法人股东的股权属于可继承财产，且公司章程无禁止性规定，其继承人可依法继承股东资格。此过程需遵循遗产继承和股权转让的相关法律法规。
- 若法人股东注销涉及破产清算等程序，其股权可能作为破产财产进行处置。
公司治理结构变化：
- 法人股东注销可能导致其委派的代表失去授权，影响公司治理结构。企业应及时调整决策和管理机制，确保治理结构的稳定性和有效性。
- 若法人股东注销导致企业股东结构发生重大变化，可能需修改公司章程或召开股东会进行决议。
出资义务问题：
- 若法人股东注销前未完全履行出资义务，企业有权要求其补足。若法人股东已注销，企业可向其清算义务人主张权利，要求其承担出资责任。
三、企业注销时法人股东已注销的处理建议
核实注销情况：
- 企业应查询工商登记档案，获取相关注销文件，核实法人股东注销的原因和程序的合法性。
确定股权处理方式：
- 根据法人股东注销前的股权处置情况和公司章程规定，采取股权转让、继承或承受、清算处理等方式确定股权归属。
修改公司章程（如需）：
- 根据股权变更情况，及时修改公司章程中关于股东信息、股权结构等内容，并按规定备案。
办理工商变更登记：
- 完成股权处理和公司章程修改后，及时向工商行政管理部门办理股东变更登记手续，确保企业登记信息的准确性和合法性。
四、注意事项
- 合法合规：处理过程中需确保所有手续合法合规，避免法律纠纷。
- 权益保护：充分考虑其他股东权益和企业整体利益，确保处理过程的公平性和合理性。
- 及时办理：及时办理相关变更登记手续，确保企业正常运营和避免不必要的法律风险。
总结来说，企业注销时法人股东并不一定会随之注销。若法人股东已注销，企业需根据相关法律法规和公司章程的规定，妥善处理其股权和权益问题，并确保处理过程的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。