事业单位人员在休年假期间被行政拘留，其工资是否会被扣发，需分情况讨论：

1. 行政拘留的性质与影响：

   • 行政拘留是一种行政处罚，通常针对违反治安管理行为但尚未构成犯罪的个人。它不同于刑事拘留，后者是刑事诉讼中的一种强制措施，针对涉嫌犯罪的嫌疑人。
   • 行政拘留期间，个人的人身自由受到限制，但这并不直接等同于丧失工作能力或违反工作纪律。

2. 年假期间的工资支付原则：

   • 年假是职工依法享有的休息休假权利，期间应视为正常出勤，享受与正常工作期间相同的工资待遇。
   • 除非有明确的法律法规或单位规章制度规定，在特定情况下（如违法、违纪等）可以扣发工资，否则单位不得随意扣发年假期间的工资。

3. 行政拘留与年假工资扣发的关系：

   • 若单位规章制度或劳动合同中有明确规定：如果事业单位的规章制度或与职工签订的劳动合同中明确规定，在职工被行政拘留期间可以扣发工资，那么单位有权按照规定执行。但这样的规定必须合法、合理，且不得违反法律法规的强制性规定。
   • 若单位规章制度或劳动合同中无明确规定：在缺乏明确规定的情况下，单位通常无权仅因职工被行政拘留就扣发其年假期间的工资。因为行政拘留并不直接等同于丧失工作能力或违反工作纪律，且年假期间应视为正常出勤。

4. 法律建议：

   • 对于事业单位而言，应制定合法、合理的规章制度，明确在何种情况下可以扣发职工工资，并确保这些规定不违反法律法规的强制性规定。
   • 对于职工而言，如果单位试图扣发其年假期间的工资，应首先查看单位规章制度或劳动合同中的相关规定。如果认为单位的做法不合法或不合理，可以向单位提出异议，或寻求法律援助以维护自己的合法权益。

总结来说，事业单位人员在休年假期间被行政拘留，其工资是否会被扣发取决于单位规章制度或劳动合同中的相关规定。在缺乏明确规定的情况下，单位通常无权扣发年假期间的工资。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。