在交通事故中，如果对事故责任有异议导致车辆被扣，由此产生的扣车费用一般不由当事人直接承担，而是由公安机关交通管理部门承担，但因扣留车辆产生的停车费等实际支出，可能需要根据具体情况来确定承担方。以下是对此问题的详细分析：
一、扣车费用的性质与承担
扣车行为本身：根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，公安机关交通管理部门因收集证据的需要，可以扣留事故车辆。这一行为是行政机关依法行使职权的行为，其产生的费用（如拖车费、保管费等行政成本）原则上应由行政机关承担，即公安机关交通管理部门负责。
停车费用：虽然扣车行为本身不产生费用，但车辆被扣留期间，如果停放在指定的停车场，可能会产生停车费用。这部分费用通常不属于行政机关的行政成本，而是实际发生的支出。然而，根据现行法律规定和司法实践，因交通事故扣留车辆所产生的停车费用，一般也不应由当事人承担。这是因为，扣留车辆是公安机关交通管理部门的行政行为，当事人不应因该行政行为而承担额外费用。
二、特殊情况下的费用承担
当事人责任导致：如果扣车是由于当事人自身的违法行为（如逃逸、拒绝配合调查等）导致的，且因此产生了额外的费用（如因逃逸而增加的拖车费、保管费等），这部分费用可能需要由当事人承担。但这种情况并不常见，且需要具体分析。
第三方服务费用：如果扣车期间，当事人自行选择了第三方服务（如自行联系拖车公司拖车、自行选择停车场停车等），并因此产生了费用，这部分费用应由当事人自行承担。因为这是当事人自主选择的行为，与公安机关交通管理部门的扣车行为无关。
三、法律建议与后续行动
了解扣车原因与期限：如果车辆被扣留，当事人应首先了解扣车的原因和期限。如果认为扣车行为不合法或扣车期限过长，可以依法提出异议或申请行政复议。
保留相关证据：在处理交通事故和扣车事宜时，当事人应保留好相关证据（如事故现场照片、交警出具的扣车凭证、停车费用发票等），以便在需要时维护自己的合法权益。
咨询专业律师：如果对扣车费用或其他交通事故相关问题有疑问或争议，建议咨询专业律师。律师可以根据具体情况提供法律意见和帮助，确保当事人的合法权益得到维护。
总结来说，在交通事故中，如果对事故责任有异议导致车辆被扣，由此产生的扣车费用一般不由当事人直接承担。但具体情况可能因地区、案件性质等因素而有所不同。因此，在处理此类问题时，建议当事人了解相关法律规定和司法实践，并咨询专业律师以获取更准确的法律意见。