结论：在摩托车被撞且定损为2000元，车辆正在维修厂修理的情况下，赔偿款项的支付对象主要取决于事故责任认定以及双方（或多方）之间的协商或法律程序结果。以下是几种可能的情况及相应的法律解释和建议：

1. 如果事故责任明确且对方全责：

   • 法律解释：根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，如果事故责任完全由对方承担，那么对方或对方的保险公司应当负责赔偿您的损失，包括车辆维修费用。
   • 建议：在这种情况下，您可以直接与对方或对方的保险公司联系，要求他们支付维修费用。通常，保险公司会要求您提供维修发票和定损报告等文件作为赔偿依据。如果对方或保险公司拒绝支付，您可以考虑通过法律途径解决，如向法院提起诉讼。

2. 如果事故责任部分由您承担：

   • 法律解释：如果事故责任并非完全由对方承担，而是您也承担了一部分责任，那么赔偿款项的支付将需要根据责任比例进行分配。
   • 建议：在这种情况下，您需要与对方或对方的保险公司协商确定各自应承担的维修费用比例。如果协商不成，您可以考虑通过法律途径解决，如申请交通事故调解或向法院提起诉讼。在调解或诉讼过程中，法院将根据事故责任认定书和其他相关证据来确定各自的责任比例和赔偿金额。

3. 如果双方对事故责任有争议：

   • 法律解释：如果双方对事故责任存在争议，无法达成一致意见，那么需要通过法律程序来确定事故责任。
   • 建议：在这种情况下，您应当及时报警并等待交警部门出具事故责任认定书。同时，您可以收集相关证据（如现场照片、证人证言等）以支持您的主张。在事故责任认定书出具后，您可以根据认定结果与对方或对方的保险公司协商赔偿事宜。如果协商不成，您可以考虑通过法律途径解决争议。

额外建议：

• 在处理此类事故时，务必保留好所有相关证据和文件，如事故现场照片、定损报告、维修发票等。这些证据将在后续协商或法律程序中起到关键作用。
• 如果可能的话，尽量与对方或对方的保险公司保持沟通并尝试通过协商解决问题。这可以节省时间和精力，并避免不必要的法律纠纷。
• 如果您对法律程序不熟悉或感到困惑，可以考虑咨询专业律师（比如我）以获取更具体的法律建议和帮助。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您有任何其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。