结论前置：辞退员工时，工资通常应当在其离职时一次性结清，这是为了保障劳动者的合法权益。不过，具体支付方式可能会因特殊情况、双方协议或地方规定而有所调整。
法律依据与常规要求
根据《工资支付暂行规定》第九条，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这意味着，在正常情况下，当用人单位辞退员工时，应一次性结算并支付员工在职期间的所有应得工资，包括但不限于基本工资、绩效工资、加班费等。
特殊情况及处理方式
尽管法律规定了应一次性结清工资，但在实际操作中，可能会遇到一些特殊情况，这时需要灵活处理：
财务流程限制：
- 若企业因财务流程、资金安排等特殊原因无法立即一次性支付工资，应与劳动者进行充分沟通，并协商确定一个合理的支付时间。
- 这种协商必须建立在劳动者同意的基础上，且不能无限制地拖延支付时间。双方应签订书面协议，明确支付时间和方式。
工资争议：
- 若双方对工资数额、计算方式或支付方式等存在争议，应先解决这些争议。
- 用人单位应在争议解决后及时支付无争议部分的工资，对于有争议的部分，可通过协商、调解、仲裁或诉讼等途径寻求解决方案。
地方特殊规定：
- 不同地区可能有不同的劳动法规或特殊规定，关于是否要求一次性结清工资也可能存在差异。例如，《北京市工资支付规定》和《广东省工资支付条例》均明确要求，用人单位与劳动者双方依法终止、解除劳动合同的，应当在终止或者解除劳动关系当日结清并一次性支付劳动者工资。
- 因此，在处理辞退员工时的工资支付问题时，还需参考当地的劳动法规和特殊规定，确保符合当地法律要求。
双方协议的重要性
- 在处理辞退员工时的工资支付问题时，双方协议至关重要。如果员工和用人单位能够就工资支付方式、时间等达成一致意见，并签订书面协议，这将有助于避免后续的纠纷和争议。
员工维权途径
若用人单位在辞退员工时不结清工资，员工可以采取以下措施维护自己的合法权益：
- 协商解决：首先尝试与用人单位进行友好协商，寻求解决方案。
- 向劳动监察部门投诉：若协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门对用人单位的违法行为进行调查和处理。
- 申请劳动仲裁：如投诉未能解决问题，员工还可以根据《劳动争议调解仲裁法》的规定，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径维护自己的权益。
总结与建议
综上所述，辞退员工时通常需要一次性结清工资，但具体支付方式需根据双方协议、地方规定及是否存在争议等因素来确定。建议用人单位在辞退员工前，充分了解相关法律法规和地方规定，并与员工进行充分沟通，确保工资支付方式的合法性和合理性。同时，对于可能存在的争议，应尽早通过协商、调解等方式予以解决，以避免不必要的法律风险和纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。