贷款二次逾期后，系统能否自动扣款取决于贷款合同的具体约定以及贷款机构的操作规则，但通常情况下，只要账户内有足够资金且扣款权限未被取消，系统仍可自动扣款。以下从不同角度进行分析：

1. 合同约定角度
   贷款合同中一般会明确约定还款方式、扣款时间及逾期处理规则。若合同中规定“逾期后仍通过原扣款账户自动划扣”，则即使发生二次逾期，只要账户状态正常（如未冻结、未注销）且余额充足，系统仍会按约定自动扣款。但若合同约定“逾期超过一定期限后转为手动还款”或“需重新授权自动扣款”，则可能影响系统自动扣款功能。

2. 贷款机构操作规则角度
   部分贷款机构在借款人首次逾期后，可能会通过短信、电话等方式提醒还款，并保留自动扣款权限；但若逾期次数较多或逾期时间较长，机构可能出于风险控制考虑，临时关闭自动扣款功能，要求借款人主动还款。此外，若借款人更换了绑定账户或解除了自动扣款授权，也会导致系统无法扣款。

3. 账户状态角度
   即使合同和机构规则允许自动扣款，若借款人绑定的还款账户余额不足、账户被冻结或注销，或银行/第三方支付平台系统故障，均可能导致自动扣款失败。此时，借款人需及时补足资金或联系机构处理账户问题。

建议：

• 立即查看贷款合同中关于“逾期还款”和“自动扣款”的条款，确认机构是否有权在二次逾期后关闭自动扣款功能；
  
• 联系贷款机构客服，核实当前账户的自动扣款状态及逾期处理规则；
  
• 若系统确实无法自动扣款，需按机构要求主动还款，避免逾期记录进一步恶化信用。
  

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