当法人股东决定注销其投资的公司时，这是一个涉及多方面法律和财务程序的复杂过程。以下是一个清晰、详细且有深度的解答，帮助您理解并处理这一情况：
一、明确公司情况与股东信息
首先，作为法人或负责注销事务的人员，您需要通过工商登记系统等合法途径，全面了解公司的具体情况，包括所有股东的基本信息、出资比例、出资方式等。这是后续操作的基础，有助于您准确判断注销的可行性和所需步骤。
二、确定注销方式
根据公司的实际情况，您需要选择适合的注销方式。如果公司未开业或无债权债务等符合简易注销条件的，可以选择简易注销程序，这通常更为快捷。如果不符合简易注销条件，则需要走一般注销程序，这涉及更多的步骤和文件准备。
三、召开股东会与成立清算组
召开股东会：尽管部分股东可能难以联系，但只要满足法定的表决权比例（通常是三分之二以上），您仍可以召开股东会并形成解散和清算的决议。在决议中，应明确注销公司的意愿、清算组的组成及职责等。
成立清算组：依据股东会决议，成立清算组。清算组应由法定代表人及其他可联系的股东、董事或专业人员组成，并在工商部门备案。清算组的主要职责是清理公司财产、编制资产负债表和财产清单、通知债权人等。
四、通知与公告债权人
清算组成立后，需在十日内通知已知债权人，并于六十日内在报纸上公告，确保所有债权人能在规定期限内申报债权。这是保障债权人权益的重要步骤，也是注销过程中的法定要求。
五、清理资产、制定并执行清算方案
清理资产：清算组应全面清查公司财产，包括固定资产、流动资产、无形资产等，并编制准确的资产负债表和财产清单。
制定清算方案：根据财产和债务情况，清算组应制定清算方案，明确清算的顺序、方式和时间等。清算方案需经股东会或人民法院确认后执行。
执行清算方案：按照清算方案，依次支付清算费用、职工工资、社保费用、税款及公司债务。如有剩余财产，按照股东的出资比例进行分配。
六、办理税务注销与其他相关手续
税务注销：向税务机关提交清算报告等相关材料，结清应纳税款及滞纳金等，办理税务注销手续。这是注销过程中的重要环节，必须确保税务事项处理完毕。
其他相关手续：同时，您还需要关注社保、银行账户等其他相关注销手续，确保公司各项事务处理完毕，避免留下后遗症。
七、准备并提交注销材料
在注销过程中，您需要细致准备包括公司章程、股东会决议、清算报告等在内的注销材料。对于无法联系的股东，应在材料中详细说明其姓名、出资比例等信息，并附上查询记录或证明。向工商行政管理部门提交注销申请及相关材料时，要确保材料的真实性和完整性。
八、办理工商注销登记
清算结束后，清算组应制作清算报告并报股东会或人民法院确认。然后，将清算报告报送公司登记机关（即工商行政管理部门）。经工商部门核准后，公司正式注销，法人资格消灭。
九、特殊情况处理
如果在清算过程中发现公司资不抵债，清算组应依法向人民法院申请宣告破产，并按照破产程序进行清算。这是处理公司无法清偿债务时的法定程序，必须严格遵守。
总结与建议：
在整个注销过程中，您必须严格按照法定程序操作，确保每一步都合法合规。遇到问题或有疑问时，应及时咨询专业的法律机构或律师以获取帮助。此外，注销公司是一个复杂且耗时的过程，建议您提前规划好时间，并准备好必要的文件和资料。如果可能的话，也可以考虑委托专业的代理机构来协助处理注销事宜，以减轻您的负担并提高效率。