企业对违法员工可以采取内部处罚，但必须遵循法律法规和内部规章制度，确保处罚的合法性与合理性。以下从不同角度详细分析：
一、企业无直接罚款权，但可依法扣减工资
企业无直接罚款权：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》，企业并未被赋予对员工进行直接罚款的权利。罚款属于行政处罚范畴，由行政机关执行，企业作为非行政机构，不具备此权力。
依法扣减工资：
- 若员工因本人原因给用人单位造成经济损失，根据《工资支付暂行规定》第十六条，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
二、企业可依据规章制度采取纪律处分
规章制度制定与公示：
- 企业若通过民主程序（如职工代表大会）制定并公示了合法的规章制度，且内容不违反法律法规，则可根据这些规章制度对违规员工进行纪律处分。
纪律处分种类：
- 警告、记过：适用于较轻的违法行为，如初次迟到、早退或偶尔违反工作流程但未造成重大损失。
- 降职、降薪：对于情节较为严重但对工作未产生毁灭性影响的违法行为，如因工作失误导致业务损失，企业可考虑降低员工的职位和薪资待遇。
- 解除劳动合同：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条，若员工严重违反用人单位的规章制度、严重失职、营私舞弊给用人单位造成重大损害，或被依法追究刑事责任等，企业有权解除劳动合同。
三、企业可要求员工承担赔偿责任
赔偿责任范围：
- 若员工的违法行为给公司造成了经济损失，根据《中华人民共和国劳动法》第一百零二条，员工应当依法承担赔偿责任。公司可以要求员工赔偿因其违法行为所造成的直接经济损失。
赔偿程序：
- 企业应确保赔偿程序的合法合规性，包括有充分的事实依据和法律依据，遵循公正、公平、公开的原则，保障员工的合法权益。
四、企业处理员工违法行为的注意事项
程序正当性：
- 企业在处理员工违法行为时，必须确保程序的正当性，给予员工申辩机会，确保决定的公正性和合理性。
保护员工合法权益：
- 企业在处理过程中应尊重员工合法权益，避免过度惩罚或侵犯员工隐私等。
合法合规性：
- 企业应确保整个处理过程的合法合规性，包括规章制度的制定和公布应符合法定程序，处罚决定应有充分的事实依据和法律依据等。
举例说明：
- 假设某员工因工作疏忽导致公司遭受经济损失，公司可根据内部规章制度对该员工进行警告或记过处分，并要求其赔偿部分经济损失（从工资中扣减，但不得超过当月工资的20%）。
- 若某员工严重违反公司规章制度，如盗窃公司财物或泄露商业秘密，公司可依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条解除与其的劳动合同，并要求其承担相应的赔偿责任。
总结与建议：
企业在处理员工违法行为时，应综合考虑违法的性质和严重程度，采取合法、合理且有效的措施。既维护公司的正当权益，又确保员工的合法权益得到尊重和保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。