面对自己的房子被他人注册了公司且不愿迁出的情况，您可以按照以下步骤来维护自己的合法权益：
一、初步准备与协商
检查租赁合同或房屋使用协议
- 仔细审查合同中关于房屋使用、注册公司、迁出条件及违约责任等条款，确保您对合同内容有清晰的理解。
- 如果合同中明确规定了公司迁出的时间和条件，这将作为您要求公司迁出的重要法律依据。
尝试友好协商
- 与公司负责人进行沟通，了解他们不愿迁出的具体原因。
- 提出一个合理的迁出时间表，并询问是否需要您提供任何协助，如推荐新的注册地址或给予一定的宽限期来完成变更手续。
二、正式通知与法律准备
发送正式书面通知
- 撰写一份正式的书面通知，明确列出公司迁出的最后期限，并告知逾期不迁出的法律后果。
- 通过邮政特快专递或其他可靠方式发送通知，并妥善保存寄送凭证，以备后续作为证据使用。
咨询专业律师
- 在采取进一步行动之前，咨询一位专业律师，了解您的法律权益和可行的法律途径。
- 根据律师的建议，准备相关证据材料，如房屋所有权证明、租赁合同、书面通知及送达凭证等。
三、行政与法律救济
向工商行政管理部门寻求协助
- 向当地工商部门反映情况，提交相关证明材料，说明公司未经您同意使用您的房屋作为注册地址且不愿迁出。
- 工商部门有权责令公司限期办理注册地址变更登记，逾期不办理的，可能面临行政处罚。
考虑提起诉讼或申请仲裁
- 如果协商、通知及行政手段均未能解决问题，您可以向有管辖权的人民法院提起民事诉讼，要求公司迁出并赔偿因非法占用房屋给您造成的损失。
- 如果租赁合同中约定了仲裁条款，您也可以选择向相应的仲裁机构申请仲裁解决争议。
执行判决或裁决
- 如果您获得了法院判决或仲裁裁决的支持，但公司仍拒不履行迁出义务，您可以申请强制执行程序。
- 强制执行措施可能包括冻结公司银行账户、查封公司财产等，以确保判决或裁决得到有效执行。
四、特殊情形处理
- 如果房屋是您自有且被非法占用注册：
- 首先尝试与公司直接沟通，要求其限期迁出。
- 如果沟通无果，您可以向公安机关报案，称公司非法占用您的房屋作为注册地址。
- 必要时，您也可以向人民法院提起诉讼，要求公司停止侵权行为并赔偿损失。
五、注意事项
- 在整个过程中，请确保您的所有行为都符合法律法规的要求，避免采取任何违法或不当手段。
- 保留好所有相关证据和文件，以便在需要时提供证明和支持您的主张。
综上所述，处理注册公司不迁出的问题需要综合运用协商、行政、法律等多种手段。请保持冷静和理性，通过专业律师的指导来维护自己的合法权益。